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wangying0923

金虫 (小有名气)

[求助] 如何通过细菌基因组找到该细菌是否有新基因 已有2人参与

从生物公司测序回来获得一株细菌的精细图,经过后续的实验获得了全基因组,想请教怎样从中找出是否有新基因的存在?知识薄弱,求大神解答
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wangying0923

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by biosci at 2016-07-29 12:43:07
所谓新,必须功能验证后才能证明新

是么,涉及到功能方面估计我就无能为力了,实验室不做功能
5楼2016-07-29 15:15:20
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biosci

捐助贵宾 (知名作家)


所谓新,必须功能验证后才能证明新

发自小木虫Android客户端
2楼2016-07-29 12:43:07
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starybirds

捐助贵宾 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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wangying0923: 金币+5 2016-07-29 15:13:53
你这其实就是想找找里面有没新的基因是吧,那你这菌是什么属什么种呢?这些应该知道吧,你可以讲他的全基因与已知的种进行比对,比对后就可以得出有没有新基因了
3楼2016-07-29 12:56:56
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wangying0923

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by starybirds at 2016-07-29 12:56:56
你这其实就是想找找里面有没新的基因是吧,那你这菌是什么属什么种呢?这些应该知道吧,你可以讲他的全基因与已知的种进行比对,比对后就可以得出有没有新基因了

这个方法也想过,一是基因组较大,比对起来不太好比对,二是感觉就算比对了也不能确定是否就是新基因,这方面不懂得太多
4楼2016-07-29 15:14:00
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