应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 如何通过细菌基因组找到该细菌是否有新基因
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
81/1返回列表
查看: 1491  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

wangying0923

金虫 (小有名气)

[求助] 如何通过细菌基因组找到该细菌是否有新基因 已有2人参与

从生物公司测序回来获得一株细菌的精细图，经过后续的实验获得了全基因组，想请教怎样从中找出是否有新基因的存在？知识薄弱，求大神解答
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-07-28 22:31:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

biosci

捐助贵宾 (职业作家)
所谓新，必须功能验证后才能证明新

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2016-07-29 12:43:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

starybirds

捐助贵宾 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wangying0923: 金币+5 2016-07-29 15:13:53
你这其实就是想找找里面有没新的基因是吧，那你这菌是什么属什么种呢？这些应该知道吧，你可以讲他的全基因与已知的种进行比对，比对后就可以得出有没有新基因了
赞一下 回复此楼
3楼2016-07-29 12:56:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangying0923

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by starybirds at 2016-07-29 12:56:56
你这其实就是想找找里面有没新的基因是吧，那你这菌是什么属什么种呢？这些应该知道吧，你可以讲他的全基因与已知的种进行比对，比对后就可以得出有没有新基因了

这个方法也想过，一是基因组较大，比对起来不太好比对，二是感觉就算比对了也不能确定是否就是新基因，这方面不懂得太多
赞一下 回复此楼
4楼2016-07-29 15:14:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangying0923

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by biosci at 2016-07-29 12:43:07
所谓新，必须功能验证后才能证明新

是么，涉及到功能方面估计我就无能为力了，实验室不做功能
赞一下 回复此楼
5楼2016-07-29 15:15:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Conan2015

新虫 (小有名气)
用prokka做基因组注释。找新基因没什么意义，每个细菌基因组都有10-60%的hypothetical protein, 你不做实验验证功能的话，得出的结论不可信。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

wangying0923
6楼2016-08-01 10:49:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangying0923

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by Conan2015 at 2016-08-01 10:49:30
用prokka做基因组注释。找新基因没什么意义，每个细菌基因组都有10-60%的hypothetical protein, 你不做实验验证功能的话，得出的结论不可信。

哦，这样啊，感觉是要做功能才行，那还是算了，谢谢！
赞一下 回复此楼
7楼2016-08-01 17:23:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

素锦流年wang

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

楼主问题不知道解决了没有？从您前面讲的感觉是一个未知菌株，后面又说想发现新的基因，不是很理解您说的，不过已知序列去和数据库进行比对这是个很好的方法，我这里有分析软件及最权威最全面的数据库，如果您数据还没有分析的话，我或许可以免费帮您分析看看。
赞一下 回复此楼
唯有努力才是永恒的需求，你若盛开，蝴蝶自来。
8楼2016-11-23 10:41:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wangying0923 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 调剂310 +7 温柔的晚安 2026-03-25 8/400 2026-03-29 01:09 by 我是小康
[考研] 各位老师好，我的一志愿为北京科技大学085601材料专硕 +7 Koxui 2026-03-28 7/350 2026-03-29 00:58 by 我是小康
[考研] 356求调剂 +3 gysy?s?a 2026-03-28 3/150 2026-03-29 00:33 by 544594351
[考研] 学硕274求调剂 +9 Li李鱼 2026-03-26 9/450 2026-03-28 21:42 by bymhappy
[考研] 本科新能源科学与工程，一志愿华理能动285求调剂 +7 AZMK 2026-03-28 11/550 2026-03-28 21:01 by xxxsssccc
[考研] 085600，材料与化工321分求调剂 +9 大馋小子 2026-03-28 9/450 2026-03-28 14:56 by 神马都不懂
[考研] 085404求调剂，总分309，本科经历较为丰富 +4 来财aa 2026-03-25 4/200 2026-03-28 07:41 by 棒棒球手
[考研] 285求调剂 +4 AZMK 2026-03-27 7/350 2026-03-27 20:59 by AZMK
[考研] 07化学280分求调剂 +10 722865 2026-03-23 10/500 2026-03-27 15:51 by Plutoqq
[考研] 一志愿华东理工大学081700，初试分数271 +6 kotoko_ik 2026-03-23 7/350 2026-03-27 12:29 by 惠州彭于晏
[考研] 359求调剂 +4 王了个楠 2026-03-25 4/200 2026-03-27 08:43 by 不吃魚的貓
[考研] 333求调剂 +6 wfh030413@ 2026-03-23 6/300 2026-03-26 22:45 by 学员8dgXkO
[考研] 化学工程085602 305分求调剂 +17 RichLi_ 2026-03-25 17/850 2026-03-26 19:44 by plmuchong
[考研] 环境专硕324分求调剂推荐 +5 轩小宁—— 2026-03-26 5/250 2026-03-26 12:05 by i_cooler
[考研] 302求调剂 +4 锦衣卫藤椒 2026-03-25 4/200 2026-03-25 16:29 by 功夫疯狂
[考研] 【2026考研调剂】制药工程 284分 求相关专业调剂名额 +4 袁奂奂 2026-03-25 8/400 2026-03-25 14:32 by lbsjt
[考研] 347求调剂 +4 L when 2026-03-25 4/200 2026-03-25 13:37 by cocolv
[考研] 环境学硕288求调剂 +8 皮皮皮123456 2026-03-22 8/400 2026-03-23 23:47 by 热情沙漠
[考研] 336化工调剂 +4 王大坦1 2026-03-23 5/250 2026-03-23 18:32 by allen-yin
[考研] 328求调剂 +4 LHHL66 2026-03-23 4/200 2026-03-23 14:55 by lbsjt
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭