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Berza

金虫 (正式写手)

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哪位大神知道怎样可以对两株菌的scafold 进行比对，并得到他们的差异基因呀？求回复~

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1楼 2016-07-25 16:40:35

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nanhu1984

银虫 (正式写手)

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★
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你要先对两个菌株的草图序列进行基因注释，最简单的方法就是提交到rast注释系统进行基因组注释（rast.nmpdr.org/ ，不会公开你的序列）或者也可以提交NCBI进行注释（同时可以拿到基因组的注释号），然后在进行基因组比较，可以采用Mauve软件，或者直接做本地blastp分析，都可以，不过本地blastP对结果的处理更加灵活。