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Ccfreesia

铜虫 (小有名气)

[求助] 表面弛豫问题求助已有1人参与

研究吸附问题时,吸附剂表面的原子需要固定么,
我将表面三层弛豫,底层固定,把吸附分子放在吸附位后进行结构优化,完成后表面原子发生了位移,表面已经乱了,
是不是我做的弛豫有问题呢,还是应该改为只在z方向上弛豫???
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Ccfreesia

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
18楼: Originally posted by 不取俗名 at 2016-07-08 13:57:48
那就放atop位好了
...

不是要放在不同位点,优化后比较吸附能,然后判断更倾向于吸附哪个位点么?

发自小木虫Android客户端
20楼2016-07-08 14:46:51
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Ccfreesia

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
21楼: Originally posted by 不取俗名 at 2016-07-08 15:28:40
你其他位不是都优化不出来吗
...

其它位点优化后表面变形严重,这样是指这些位点的吸附不成立?可以这样理解么。。。

发自小木虫Android客户端
22楼2016-07-08 16:42:00
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Ccfreesia

铜虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
23楼: Originally posted by 朱全喜 at 2016-07-08 19:20:58
取决于你关注什么。如果关注对象就是表面几何结构以便于和实验结果相对照(比如STM或LEED等),那么肯定得全驰豫;如果是关注表面上一些高对称吸附位对最终表面性能有何影响,那么固定XY坐标就是为了提取出单一因素 ...

嗯我懂了。。万分感谢,一直都是自己摸索有很多不懂的东西,您的讲解给我的帮助很大,真的很感激

发自小木虫Android客户端
25楼2016-07-08 23:06:46
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Ccfreesia

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
23楼: Originally posted by 朱全喜 at 2016-07-08 19:20:58
取决于你关注什么。如果关注对象就是表面几何结构以便于和实验结果相对照(比如STM或LEED等),那么肯定得全驰豫;如果是关注表面上一些高对称吸附位对最终表面性能有何影响,那么固定XY坐标就是为了提取出单一因素 ...

不好意思~又来麻烦您了我选用了四层表面模型,最底层全固定,表面三层x,y方向固定,吸附分子不固定,想要用Dmol3模块进行几何优化,但对话框提示计算无法进行,请问我之前的设置出现哪些问题了呢~~
表面弛豫问题求助
IMG_20161006_203119.jpg

26楼2016-10-08 10:50:25
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