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JoyHale

新虫 (初入文坛)

[求助] Amp板子上长了好多杂菌!问题比较复杂,请各位进来看。很急,请各位大神给点建议! 已有1人参与

最近在做转化效率,酶切效率,和连接效率的检验。 我们用了一个带有sfgfp绿色荧光的质粒(带有Amp抗性),转到感受态里面, 涂A+的板子 (3个平行); 再用双酶切这个质粒,把sfgfp去掉,回收,再把backbone和感受态混合,涂板(3个);再一组双酶切,切胶回收backbone 和 sfgfp,quickligase连接,然后转入感受态(3个)。
14个小时之后,第一组转化:很多菌落,几千个左右吧,3/4的绿色。  第二组,酶切---很多菌落(几十个~一百个吧)只有一个亮的。 第三组连接-----很多菌落(一百个吧),有四个亮的。  
想问下为什么会有这种情况,这个实验重复了好多次,每次几乎都这样。  长了很多没有绿色荧光的杂菌。 非常不合理,本来只有绿色荧光的质粒才有Amp抗性啊!
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JoyHale

新虫 (初入文坛)

对了,用的酶是AscI 和 XbaI.
2楼2016-07-02 15:46:50
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51mimi

新虫 (小有名气)

载体可能自连  ,还还是和你的片段与载体比例有很大关系

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-07-03 11:47:31
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鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
JoyHale(youlinglyw代发): 金币+5, 赠人玫瑰手有余香,生物科学有你更精彩 2016-07-06 15:55:43
第一组:直接转质粒,长那么多很正常
第二组:只转化载体骨架长一个亮的,说明你的载体回收的还可以,但也有些没切开的。但是长那么多不亮的,是污染了还是咋了?感觉自连不会那么多啊,而且位点不同。
第三组:长的这四个有可能是原质粒,有可能是目的质粒,提了鉴定一下。  别的那些我推测是污染了,我自己做有时候也这样,提了质粒都不对,分析不出原因。
   现在夏天到了,是污染最严重的时候,特别注意污染问题,祝好。
4楼2016-07-06 15:50:28
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不爱做实验

银虫 (正式写手)

1、污染问题:实验过程中要特别注意
2、连接效率:
    (1)一般16℃左右连接5-7个小时即可,或者过夜连接也可以
    (2)连接体系中片段和载体的比例习惯是3:1,或者再大一点
3、酶切问题:可以加大质粒的量,过获得一些片段和载体。
4、转化后恒温培养的时间一般过夜,第二天早上即可,不要太久。
     你出现的是不是卫星菌落。
5、Amp是否已经不太好用了

最后,还是建议加大酶切量,并保证回收效果和回收量。
5楼2016-07-07 14:17:40
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