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zhangmao511

铁虫 (小有名气)

应助: 2 (幼儿园)
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红花: 2
帖子: 136
在线: 29.7小时
虫号: 2553312
注册: 2013-07-19
性别: GG
专业: 蛋白质组学

[求助] ABI SOLID测序平台的接头序列（adapter）有哪些，如何找呢？谢谢

请教一下，有朋友了解 ABI SOLID测序平台吗？
我有一组来自ABI SOLID测序平台的RNA测序fastq结果。现在想进行去接头的处理，但是不知道ABI SOLID的接头序列是哪些？
有朋友了解吗？能提示一下，谢谢！！

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zhangmao511

铁虫 (小有名气)

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引用回帖:

2楼: Originally posted by ygidtu at 2016-06-19 23:42:45
测序平台的官网，是有各种他们用的接头序列的，你找到那个文件。然后fastqc看一下最多的那些重复序列，去跟官网的接头序列比对一下，一般能找到。PS:你既然测了序，直接问测序公司，他们应该会告诉你才对
...

一般接头序列的长度是多少啊？
我用fastqc看了下，出现最多的只有一条就是"NNNNNNNN…………………………"