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zhangmao511兑换贵宾
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ABI SOLID测序平台的接头序列（adapter）有哪些，如何找呢？谢谢
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请教一下，有朋友了解 ABI SOLID测序平台吗？ 我有一组来自ABI SOLID测序平台的RNA测序fastq结果。现在想进行去接头的处理，但是不知道ABI SOLID的接头序列是哪些？ 有朋友了解吗？能提示一下，谢谢！！ |
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3楼2016-06-21 10:53:59
ygidtu
实习版主
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西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2016-06-20 07:39:56
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2016-06-20 07:39:56
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测序平台的官网，是有各种他们用的接头序列的，你找到那个文件。然后fastqc看一下最多的那些重复序列，去跟官网的接头序列比对一下，一般能找到。PS:你既然测了序，直接问测序公司，他们应该会告诉你才对 发自小木虫Android客户端 |
2楼2016-06-19 23:42:45
4楼2016-06-21 10:56:23
ygidtu
版主
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fastqc里有一项是adapter content，你看一下这个曲线，如果有波动代表有接头，平的为0，就是没有接头。一般来说GEO上的数据都是去过接头的，那项内容合格就没有任何问题了 发自小木虫Android客户端 |
5楼2016-06-21 11:49:31
