24小时热门版块排行榜    

查看: 1595  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)

[求助] read_data使用后,in文件的编写 已有1人参与

具体说明,在in文件中用create_atom命令在region中添加了一种类型的原子,比如create_atoms  1  region  tool,那在data中原子种类为1、 2 ,这样的话,怎么设置data中的原子和in文件中的原子之间的pair_style和pair_coeff,in文件中1类原子和data中的1类原子怎么区分
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 影子政 at 2016-06-16 17:29:34
我不太懂你的意思。
用了region后,又用read_data, box区域不会覆盖吗? 一般不都是先read_data,再用region修改data的相关性质吗。
”in文件中开始在region中添加了1类原子(Cu)“应该是划分好region后用 set ...

很感谢您这么细致的回复,对于“用了region后,又用read_data, box区域不会覆盖吗? ”这个问题,我先用region然后用create_box,在使用read_data命令时,加上了add append的关键词,就不会覆盖。
我的问题就是您说的这个““read_data命令所读取的data文件中,同样也有标识为1的原子种类,但这在data文件中表示的是H原子”  data文件也有标识为1的原子种类,你说是表示H原子的,这不和你的Cu冲突了吗?”,就想问问这个冲突怎么解决?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2016-06-17 17:10:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

影子政

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
胜利笑哈哈: 金币+10, 有帮助 2016-06-22 10:29:06
”在in文件中用create_atom命令在region中添加了一种类型的原子“
不是用create_atom命令吧,而是set region type ID。  

in文件中1类原子和data中的1类原子怎么区分?
data文件中就有type 这一项(1,2.....) 对应pair_coeff(比如  pair_coeff * * FeCrHe.eam  Fe Cr He) 中1对应Fe,2对应Cr等等。

我没有试过在read_data后,修改了某一region的原子类型是否会反应在data文件中。但是不管怎么改,pair_coeff后的参数与type 对应。
if I rest,I rust!
2楼2016-06-15 10:53:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 影子政 at 2016-06-15 10:53:44
”在in文件中用create_atom命令在region中添加了一种类型的原子“
不是用create_atom命令吧,而是set region type ID。  

in文件中1类原子和data中的1类原子怎么区分?
data文件中就有type 这一项(1,2.....) 对 ...

感谢您的回复,不过我说的意思是怎样将data中的原子种类和in文件中原子种类进行区分,比如说在in文件中开始在region中添加了1类原子(Cu),那么我再使用read_data命令所读取的data文件中,同样也有标识为1的原子种类,但这在data文件中表示的是H原子,这样的情况怎么出来?
3楼2016-06-15 21:16:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

影子政

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 胜利笑哈哈 at 2016-06-15 21:16:47
感谢您的回复,不过我说的意思是怎样将data中的原子种类和in文件中原子种类进行区分,比如说在in文件中开始在region中添加了1类原子(Cu),那么我再使用read_data命令所读取的data文件中,同样也有标识为1的原子种 ...

我不太懂你的意思。
用了region后,又用read_data, box区域不会覆盖吗? 一般不都是先read_data,再用region修改data的相关性质吗。
”in文件中开始在region中添加了1类原子(Cu)“应该是划分好region后用 set region type ID   你用ID (=1)来表示Cu;

而“read_data命令所读取的data文件中,同样也有标识为1的原子种类,但这在data文件中表示的是H原子”  data文件也有标识为1的原子种类,你说是表示H原子的,这不和你的Cu冲突了吗?

不管是in文件还是data ,固定的type ID 只表示一种原子, 你在region中确定Cu为ID=1,那意味着 pair_coeff后原子种类第一个为Cu;(比如  pair_coeff * * CuH.eam  Cu H) 中1对应Cu,2对应H等等;而你的data文件也有标识为1 的原子,那这些原子的类型只能是Cu了。若想区别两者需用不同的type ID 并对应的修改 pair_coeff

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

if I rest,I rust!
4楼2016-06-16 17:29:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 i3cz6qj6l2 2026-02-17 3/150 2026-02-18 11:09 by lqtl9djx19
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 i3cz6qj6l2 2026-02-17 3/150 2026-02-18 10:54 by lqtl9djx19
[考研] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 i3cz6qj6l2 2026-02-17 3/150 2026-02-18 10:39 by lqtl9djx19
[考研] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-17 3/150 2026-02-18 08:53 by lqtl9djx19
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-17 3/150 2026-02-18 08:38 by lqtl9djx19
[找工作] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 pnpwoqbg8f 2026-02-17 4/200 2026-02-18 07:55 by lotyj5cz79
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-16 4/200 2026-02-18 07:40 by lotyj5cz79
[考研] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 pnpwoqbg8f 2026-02-16 4/200 2026-02-18 07:38 by lotyj5cz79
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 pnpwoqbg8f 2026-02-16 4/200 2026-02-18 07:23 by lotyj5cz79
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 pnpwoqbg8f 2026-02-16 4/200 2026-02-18 07:08 by lotyj5cz79
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-16 3/150 2026-02-18 06:53 by lotyj5cz79
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-17 3/150 2026-02-18 00:40 by tk2gfblvuz
[找工作] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-17 4/200 2026-02-18 00:23 by tk2gfblvuz
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-17 3/150 2026-02-17 23:40 by tk2gfblvuz
[基金申请] 基金正文30页指的是报告正文还是整个申请书 +3 successhe 2026-02-16 4/200 2026-02-17 20:56 by successhe
[基金申请] 今年春晚有几个节目很不错,点赞! +5 瞬息宇宙 2026-02-16 6/300 2026-02-17 12:49 by jymy19840415
[微米和纳米] 球磨粉体时遇到了大的问题,请指教! 10+3 6sbiam 2026-02-12 15/750 2026-02-16 15:03 by tgzxzqj
[基金申请] 过年走亲戚时感受到了所开私家车的鄙视链 +3 瞬息宇宙 2026-02-15 5/250 2026-02-16 14:23 by aspect3000
[基金申请] 情人节自我反思:在爱情中有过遗憾吗? +4 瞬息宇宙 2026-02-15 5/250 2026-02-15 22:28 by baiboxie
[硕博家园] 江汉大学解明教授课题组招博士研究生/博士后 +3 cleverlyy 2026-02-12 3/150 2026-02-12 21:02 by qsdf1
信息提示
请填处理意见