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read_data使用后，in文件的编写 已有1人参与
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| 具体说明，在in文件中用create_atom命令在region中添加了一种类型的原子，比如create_atoms 1 region tool，那在data中原子种类为1、 2 ，这样的话，怎么设置data中的原子和in文件中的原子之间的pair_style和pair_coeff，in文件中1类原子和data中的1类原子怎么区分 |
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
胜利笑哈哈: 金币+10, ★有帮助 2016-06-22 10:29:06
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胜利笑哈哈: 金币+10, ★有帮助 2016-06-22 10:29:06
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”在in文件中用create_atom命令在region中添加了一种类型的原子“ 不是用create_atom命令吧，而是set region type ID。 in文件中1类原子和data中的1类原子怎么区分? data文件中就有type 这一项（1,2.....) 对应pair_coeff（比如 pair_coeff * * FeCrHe.eam Fe Cr He) 中1对应Fe,2对应Cr等等。 我没有试过在read_data后，修改了某一region的原子类型是否会反应在data文件中。但是不管怎么改，pair_coeff后的参数与type 对应。 |
2楼2016-06-15 10:53:44
3楼2016-06-15 21:16:47
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我不太懂你的意思。 用了region后，又用read_data， box区域不会覆盖吗？ 一般不都是先read_data，再用region修改data的相关性质吗。 ”in文件中开始在region中添加了1类原子（Cu）“应该是划分好region后用 set region type ID 你用ID (=1)来表示Cu； 而“read_data命令所读取的data文件中，同样也有标识为1的原子种类，但这在data文件中表示的是H原子” data文件也有标识为1的原子种类，你说是表示H原子的，这不和你的Cu冲突了吗？ 不管是in文件还是data ，固定的type ID 只表示一种原子， 你在region中确定Cu为ID=1，那意味着 pair_coeff后原子种类第一个为Cu；（比如 pair_coeff * * CuH.eam Cu H) 中1对应Cu,2对应H等等；而你的data文件也有标识为1 的原子，那这些原子的类型只能是Cu了。若想区别两者需用不同的type ID 并对应的修改 pair_coeff |
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胜利笑哈哈4楼2016-06-16 17:29:34
5楼2016-06-17 17:10:15
6楼2016-06-20 11:04:26
tina张
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