| 查看: 2942 | 回复: 12 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
wangzhou79铁杆木虫 (正式写手)
|
[交流]
转录组数据中pathway category的选取咨询，谢谢大家
|
||
|
大家好，最近做了转录组测序，找华大做的，现在在pathway条目选取中遇到了点问题，特来请教各位大牛。 在pathway的聚类分析中，报告里给了显著性检测，p-value和q-value，其中p值是显著性检测，q值是假发现率，报告里的说明了指出，以q值小于等于0.05的为显著性聚类，可是这样一来，我的样品中，能够聚类的条目只有一两个，如果是只看p值的话，那还好点，不知道是否一定要以q值来选取聚类条目呢，那些q>0.05而p＜0.05的条目是否有参考价值，还需要对这些条目做哪些进一步分析，可以用来作为差异性的pathway来分析和写到文章里么？谢谢！ 另外，请教一下大牛们，转录组分析是不是不能只看公司的报告，自己还能做哪些分析，得到一些更好的信息，谢谢大家！ |
回复此楼» 猜你喜欢
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有276人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
-
氢氧化钾活化操作
已经有18人回复
-
散金
已经有68人回复
-
生物质超级电容器
已经有0人回复
行板如歌
金虫 (小有名气)
- 应助: 99 (初中生)
- 金币: 1061.9
- 红花: 2
- 帖子: 271
- 在线: 92.2小时
- 虫号: 704928
- 注册: 2009-02-20
- 性别: GG
- 专业: 园艺作物采后生物学
7楼2016-06-18 21:58:45
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
wangzhou79: 金币+5 2016-06-15 06:06:27
xn8008: 金币+1, 支持积极回帖，不过希望以后把您的建议写在帖子里，供大家学习，谢谢 2016-06-15 10:29:49
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
wangzhou79: 金币+5 2016-06-15 06:06:27
xn8008: 金币+1, 支持积极回帖，不过希望以后把您的建议写在帖子里，供大家学习，谢谢 2016-06-15 10:29:49
|
如果筛选出来的太少，就放宽条件，我也是做转录的，方便的话，留点信息，我加你 发自小木虫Android客户端 |
4楼2016-06-14 23:30:17
wangzhou79
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 6232.3
- 散金: 2243
- 红花: 1
- 帖子: 920
- 在线: 307.5小时
- 虫号: 848766
- 注册: 2009-09-15
- 性别: GG
- 专业: 微生物生理与生物化学
5楼2016-06-15 06:12:54
ygidtu
新虫 (正式写手)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 1690.7
- 散金: 798
- 红花: 3
- 帖子: 419
- 在线: 117.7小时
- 虫号: 2854989
- 注册: 2013-12-07
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
wangzhou79: 金币+3 2016-06-24 22:31:34
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
wangzhou79: 金币+3 2016-06-24 22:31:34
|
一般都不采用p的，不论pq，0.05都是一道坎，可以尝试放宽别的条件再做一次pathway富集 发自小木虫Android客户端 |
8楼2016-06-18 22:31:18
