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zhangxf2014

新虫 (小有名气)

[求助] PCR扩增 已有4人参与

请教: 最近在做PCR扩增,进行PCR产物胶回收,电泳检测结果没有条带,这是什么原因造成的?之后做连接转化(均按说明书进行),菌液检测都是空载,请大家帮忙分析下,哪里出问题了?谢谢!

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Bioexperixgs

新虫 (正式写手)

没条带竟然还有胆量继续往下做,佩服楼主

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10楼2016-06-14 23:13:34
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普通回帖

寂寞之巅

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 分子生物版块鼓励您发帖积极交流,myprayer祝您科研顺利,文章多多。 2016-06-12 17:43:53
不是应该先确认你的PCR反应体系,PCR程序是不是正确的吗?PCR完成后跑个胶看有没有目的条带再做后续实验吧
好好学习,天天向上
2楼2016-06-12 09:55:42
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原海亮

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰·手有余香,谢谢你的理解与支持。祝您科研顺利,文章多多。 2016-06-12 17:44:12
首先你回收完片段检测不到,进行转化出现空载也就很正常了,另外进行pcr后,回收前,目的条带的特异性,浓度怎么样呢?你需要确定是pcr问题还是回收的问题,祝好。

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天空才是极限,我有信心飞的更高!
3楼2016-06-12 12:08:36
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zhangxf2014

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 原海亮 at 2016-06-12 12:08:36
首先你回收完片段检测不到,进行转化出现空载也就很正常了,另外进行pcr后,回收前,目的条带的特异性,浓度怎么样呢?你需要确定是pcr问题还是回收的问题,祝好。
...

PCR产物的大小为500bp左右,单一条带。回收后测的浓度是15.2ng/ul 。但是电泳跑不出条带,是回收的问题么?

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4楼2016-06-12 17:04:06
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ssswzf

金虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangxf2014 at 2016-06-12 17:04:06
PCR产物的大小为500bp左右,单一条带。回收后测的浓度是15.2ng/ul 。但是电泳跑不出条带,是回收的问题么?
...

pcr产物回收率用超微量测试是不准确的,胶回收一般用的是高序列盐,很难去除干净的,会影响你的检测结果,最可靠的办法是用电泳检测,按照你说的PCR产物500bp,条带单一的话也可以不用进行胶回收实验的哦,你可以直接通过pcr产物纯化试剂盒来做,简单快捷,而且用pcr产物纯化以后你可以用超微量来检测(非高序列盐),磁珠法pcr产物纯化试剂可以在15min内完成实验,不需要离心机,回收率最高可达95%左右,
可以联系Q 619857031,具体沟通一下,郑州英诺生物科技有限公司
5楼2016-06-13 12:59:38
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504775490

金虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
pcr后电泳条带单一的话说明PCR这一步没有问题,如果后续只是克隆到载体用于模板扩增的话可以选择试剂盒,用pcr产物和Buffer直接连接到克隆的T载体上,不需要酶切,直接测序就好。如果是用于表达构建的,很可能问题出现做你胶回收这步,一般情况下用试剂盒是不太会出问题的,你检查一下盒子里的东西有没有问题,柱子是不是完好,祝实验顺利
6楼2016-06-13 14:38:58
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wellsunshine

新虫 (初入文坛)

PCR有几处容易出问题,比如,引物设计,设计不好很容易产生引物二聚体,电泳结果是单一条带。还有,回收是怎么做的,我们这边一般是用试剂盒,结果一般没什么问题。

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7楼2016-06-13 15:26:34
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祝福
8楼2016-06-13 16:29:07
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zhangxf2014

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 504775490 at 2016-06-13 14:38:58
pcr后电泳条带单一的话说明PCR这一步没有问题,如果后续只是克隆到载体用于模板扩增的话可以选择试剂盒,用pcr产物和Buffer直接连接到克隆的T载体上,不需要酶切,直接测序就好。如果是用于表达构建的,很可能问题出 ...

谢谢

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9楼2016-06-13 21:22:41
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