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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

11楼2016-06-08 21:43:40
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804371539

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
设计引物的时候大小应该知道吧,按照预估的切
12楼2016-06-08 21:53:23
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angelyou

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以试试直接都测序,因为有些短的可能是末端降解之后的产物,亲身经验,短的序列是一样的,只是少一段。
13楼2016-06-08 21:55:56
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armigera

金虫 (正式写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by yuguiyan at 2016-06-08 19:27:24
基因组没公布,好多基因序列都不晓得
...

先简并引物拿到一段序列,在特异引物做RACE

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14楼2016-06-09 09:49:44
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hihe99

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by yuguiyan at 2016-06-08 18:02:05
第一轮和第二轮引物需要距离多远啊?有啥特殊要求吗
...

好像距离上没什么特别要求吧,主要看你需要吧。我用经典的方法感觉产物长度最好在500以上

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15楼2016-06-09 14:14:44
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hihe99

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by yuguiyan at 2016-06-08 18:02:05
第一轮和第二轮引物需要距离多远啊?有啥特殊要求吗
...

主要还是看引物特异性吧

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16楼2016-06-09 14:15:42
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president114

新虫 (正式写手)

你估计下3‘端最小有多大,少于这些的都扔了,加上ploy a 算下大小~
行路难多歧路
17楼2016-06-09 16:01:16
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 我欲乘风归去 at 2016-06-08 18:54:17
做3‘RACE保守点的方法应该把其他物种的同源基因序列做比对,找一段保守序列扩增出来测序,再根据这段序列设计3race引物。

请问基因保守性你一般用NCBI的blast吗?还是有其他软件?

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18楼2016-06-09 19:56:04
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zxd95

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以全部克隆测序,然后拼接,看哪个能够拼的上

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追梦的人
19楼2016-06-09 21:32:43
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shizishanshang

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你为什么不做第二轮?费很大劲吗?
20楼2016-06-10 01:07:26
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