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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)

[求助] CINEB 找过渡态如何确定IBRION 和POTIM 的参数设置已有2人参与

各位虫子,,请教一下,,,用CINEB找过渡态的时候,,IBRION 和POTIM 的参数设置如何确定??之前有看到说,,推荐IBRION= 3(使用damped MD),  POTIM =0.30,在使用 IBRION = 3 的时候,POTIM不能过大(可能导致不收敛),也不能过小(可能导致收敛速度很慢) 。 VTST官网上有说 POTIM = 0, 这两个参数到底应该怎么设定呢???
各位走过路过,给点儿指点吧,,,,多谢多谢啦
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emilyoyang

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 抖抖豆豆 at 2016-06-08 11:42:34
大神你怎么看?说下你的意见吧~~~~~...

建议你仔细读读CI-NEB官网的说明,上面写的很清楚。
首先你要明白,NEB本质上就是relaxation,针对不同的image 做relaxation
IBRION=3 and POTIM=0是关掉VASP自带的optimizer,进而选这CI-NEB他们课题组自己develop的optimizer(IOPT)

如果要算CI-NEB,最好用 CI-NEB他们课题组自己develop的optimizer(IOPT),计算效率高(详见CI-NEB原始文献)

IOPT的设置 你看这里
http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/optimizers.html
9楼2016-06-11 21:22:06
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未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
抖抖豆豆: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-06-08 11:43:03
仔细查VTST官网上有说 POTIM = 0是算什么的,粒子步都不动,咋搜过渡态呢
3楼2016-06-08 11:08:30
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emilyoyang

木虫 (正式写手)

引用回帖:
12楼: Originally posted by 笑然49 at 2016-06-13 10:20:04
谢谢回复,如果我想对比这两个能量,结构一致,其它参数都一致,只有两个参数不同,优化时设置IBRION=2,POTIM=0.5;CI-NEB方法设置IBRION=3,POTIM=0这样可以吗?...

Nvm...... 你要对比能量是否一致,初始结构要相同,relax/CI-NEB 完的结构也要相同 才能对比。你对过渡态结构 进行优化(IBRION=2,POTIM=0.5),有可能最终得到的结构 跟你初始结构(过渡态结构)完全不一样了。那这样就不具有对比性了。
15楼2016-06-13 13:35:55
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普通回帖

蛋蛋小童鞋

版主 (著名写手)

我设置的是0,现在还没有成功

发自小木虫Android客户端
愿不负最苦的时光
2楼2016-06-08 10:47:00
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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 蛋蛋小童鞋 at 2016-06-08 10:47:00
我设置的是0,现在还没有成功

有结果了支一声,,,我先设置了0.3
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4楼2016-06-08 11:40:49
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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2016-06-08 11:08:30
仔细查VTST官网上有说 POTIM = 0是算什么的,粒子步都不动,咋搜过渡态呢

大神你怎么看?说下你的意见吧~~~~~
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5楼2016-06-08 11:42:34
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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)

6楼2016-06-08 14:45:33
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微6凉

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
抖抖豆豆: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-06-10 23:17:28
和你之前的设置一样就可以吧!我们做过渡态搜索的时候只需要在之前的INCAR中加上一些和过渡态搜索有关的参数即可
7楼2016-06-10 09:14:15
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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 微6凉 at 2016-06-10 09:14:15
和你之前的设置一样就可以吧!我们做过渡态搜索的时候只需要在之前的INCAR中加上一些和过渡态搜索有关的参数即可

先谢谢回帖, 因为我有看到,POTIM= 0, 然后也看到过帖子说POTIM 在0和0.5 之间,  所以不太确定,,,您的意思是就和之前优化结构时用同样的POTIM吗 ?
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8楼2016-06-10 23:19:29
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笑然49

金虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by emilyoyang at 2016-06-11 21:22:06
建议你仔细读读CI-NEB官网的说明,上面写的很清楚。
首先你要明白,NEB本质上就是relaxation,针对不同的image 做relaxation
IBRION=3 and POTIM=0是关掉VASP自带的optimizer,进而选这CI-NEB他们课题组自己deve ...

您好,我想请问一下,我用CI-NEB方法计算的过渡态能量和结构优化得到的能量不一致这正常吗?我想计算初始态和过渡态之间的能量差,看文献用CI-NEB方法和结构优化得到的能量差一致,但我得到的却不一致,求赐教。
smile
10楼2016-06-12 20:00:21
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