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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » CINEB 找过渡态如何确定IBRION 和POTIM 的参数设置
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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)

[求助] CINEB 找过渡态如何确定IBRION 和POTIM 的参数设置 已有2人参与

各位虫子，，请教一下，，，用CINEB找过渡态的时候，，IBRION 和POTIM 的参数设置如何确定？？之前有看到说，，推荐IBRION= 3（使用damped MD),  POTIM =0.30，在使用 IBRION = 3 的时候，POTIM不能过大（可能导致不收敛），也不能过小（可能导致收敛速度很慢） 。 VTST官网上有说 POTIM = 0， 这两个参数到底应该怎么设定呢？？？
各位走过路过，给点儿指点吧，，，，多谢多谢啦
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work doesn't work without play
1楼 2016-06-08 10:45:07
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

emilyoyang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 抖抖豆豆 at 2016-06-08 11:42:34
大神你怎么看？说下你的意见吧~~~~~...

建议你仔细读读CI-NEB官网的说明，上面写的很清楚。
首先你要明白，NEB本质上就是relaxation，针对不同的image 做relaxation
IBRION=3 and POTIM=0是关掉VASP自带的optimizer，进而选这CI-NEB他们课题组自己develop的optimizer（IOPT）

如果要算CI-NEB，最好用 CI-NEB他们课题组自己develop的optimizer(IOPT)，计算效率高（详见CI-NEB原始文献）

IOPT的设置 你看这里
http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/optimizers.html
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9楼2016-06-11 21:22:06
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未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
抖抖豆豆: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-06-08 11:43:03
仔细查VTST官网上有说 POTIM = 0是算什么的，粒子步都不动，咋搜过渡态呢
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3楼2016-06-08 11:08:30
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emilyoyang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 笑然49 at 2016-06-13 10:20:04
谢谢回复，如果我想对比这两个能量，结构一致，其它参数都一致，只有两个参数不同，优化时设置IBRION=2，POTIM=0.5；CI-NEB方法设置IBRION=3，POTIM=0这样可以吗？...

Nvm...... 你要对比能量是否一致，初始结构要相同，relax/CI-NEB 完的结构也要相同 才能对比。你对过渡态结构 进行优化（IBRION=2，POTIM=0.5），有可能最终得到的结构 跟你初始结构（过渡态结构）完全不一样了。那这样就不具有对比性了。
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15楼2016-06-13 13:35:55
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蛋蛋小童鞋

版主 (著名写手)
我设置的是0，现在还没有成功

发自小木虫Android客户端
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愿不负最苦的时光
2楼2016-06-08 10:47:00
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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 蛋蛋小童鞋 at 2016-06-08 10:47:00
我设置的是0，现在还没有成功

有结果了支一声，，，我先设置了0.3
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4楼2016-06-08 11:40:49
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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2016-06-08 11:08:30
仔细查VTST官网上有说 POTIM = 0是算什么的，粒子步都不动，咋搜过渡态呢

大神你怎么看？说下你的意见吧~~~~~
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5楼2016-06-08 11:42:34
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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)
6楼2016-06-08 14:45:33
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微6凉

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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抖抖豆豆: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-06-10 23:17:28
和你之前的设置一样就可以吧！我们做过渡态搜索的时候只需要在之前的INCAR中加上一些和过渡态搜索有关的参数即可
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7楼2016-06-10 09:14:15
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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 微6凉 at 2016-06-10 09:14:15
和你之前的设置一样就可以吧！我们做过渡态搜索的时候只需要在之前的INCAR中加上一些和过渡态搜索有关的参数即可

先谢谢回帖, 因为我有看到,POTIM= 0, 然后也看到过帖子说POTIM 在0和0.5 之间,  所以不太确定,,,您的意思是就和之前优化结构时用同样的POTIM吗 ?
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8楼2016-06-10 23:19:29
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笑然49

金虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by emilyoyang at 2016-06-11 21:22:06
建议你仔细读读CI-NEB官网的说明，上面写的很清楚。
首先你要明白，NEB本质上就是relaxation，针对不同的image 做relaxation
IBRION=3 and POTIM=0是关掉VASP自带的optimizer，进而选这CI-NEB他们课题组自己deve ...

您好，我想请问一下，我用CI-NEB方法计算的过渡态能量和结构优化得到的能量不一致这正常吗？我想计算初始态和过渡态之间的能量差，看文献用CI-NEB方法和结构优化得到的能量差一致，但我得到的却不一致，求赐教。
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smile
10楼2016-06-12 20:00:21
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