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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 一个全长为1000多bp的基因 想从中间找一段4,5百bp的特异性片段
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黄启秀

新虫 (正式写手)

[求助] 一个全长为1000多bp的基因 想从中间找一段4,5百bp的特异性片段 已有1人参与

如题～求帮助(?￣▽￣)?一个全长为1000多bp的基因  想从中间找一段4,5百bp的特异性片段，设计引物，用于连沉默载体～  怎么找尼……

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1楼 2016-06-07 12:47:50
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原海亮

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个问题没有讲太清楚，这四五百bp你自己也不确定是哪段序列么？还是已经确定了这段序列，需要设计引物扩增这个序列？如果是后者，既然序列已经确定，我觉得没有太多优化的余地，只能从开头到结尾来设计，最后可以调整引物长短及酶切位点，拿到最合适的引物。

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黄启秀
天空才是极限，我有信心飞的更高！
2楼2016-06-07 17:50:06
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黄启秀

新虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 原海亮 at 2016-06-07 17:50:06
这个问题没有讲太清楚，这四五百bp你自己也不确定是哪段序列么？还是已经确定了这段序列，需要设计引物扩增这个序列？如果是后者，既然序列已经确定，我觉得没有太多优化的余地，只能从开头到结尾来设计，最后可以调 ...

(?￣▽￣)?

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3楼2016-06-07 21:34:16
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hualidy

新虫 (初入文坛)
★
xn8008: 金币+1, 建议不错，希望可以说的更详细点 2016-06-09 17:24:25
建议先分析序列的保守性，然后确定片段大小，再做引物设计。

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4楼2016-06-08 11:09:47
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armigera

金虫 (正式写手)
★ ★
xn8008: 金币+2, 建议很好，继续加油 2016-06-09 17:24:48
建议尽量贴近3端～这样沉默效率高

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黄启秀
5楼2016-06-09 15:39:31
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黄启秀

新虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by armigera at 2016-06-09 15:39:31
建议尽量贴近3端～这样沉默效率高

thank~

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6楼2016-06-09 16:46:39
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