24小时热门版块排行榜    

查看: 2048  |  回复: 7

diandianer

铜虫 (初入文坛)

[求助] 利用abinit计算声子出现问题 已有1人参与

我是abinit的初学者,在利用abinit 计算H3S的声子的第二步的时候,就是利用anaddb做并行计算的时候,log文件提示:

Calculation of the interatomic forces

-begin at tcpu      0.071  and twall      0.336 sec
       Body-Centered Lattice Grid
mkifc9 : will extract the dipole-dipole part,
using ewald9, q0dy3 and nanal9 for every wavevector.
然后计算就卡住不动了,提交的状态上还是run,但是log文件和out文件再也没往后写东西,一卡就卡了100多个小时,请问这是怎么回事?该如何利用abinit算声子?

下面的附件里
INP是利用abinit计算各个q点的本征频率的输入文件。
teph_5.in 是之后利用anaddb计算出声子谱的输入文件,log_5 和 teph_5.out是出错的这一步的log文件和输出文件。

谢谢各位大神
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

~~~~(>_<)~~~~
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

diandianer

铜虫 (初入文坛)

我不知道为什么我无法上传文件,附件的东西我只能写在回复里了
INP:
# Crystalline AlAs : computation of the phonon spectrum

   ndtset  10
#Set 1 : ground state self-consistency
occopt 6
tsmear 0.001
  getwfk1   0            # Cancel default
  kptopt1   1            # Automatic generation of k points, taking
                         # into account the symmetry
    nqpt1   0            # Cancel default
  tolvrs1   1.0d-18      # SCF stopping criterion (modify default)
  rfphon1   0            # Cancel default
dilatmx1    2.00
ecutsm1     0.5
#strprecon  0.1
strtarget1  -6.797858d-3  -6.797858d-3  -6.797858d-3  0  0  0
#Q vectors for all datasets

#Complete set of symmetry-inequivalent qpt chosen to be commensurate
# with kpt mesh so that only one set of GS wave functions is needed.
#Generated automatically by running GS calculation with kptopt=1,
# nshift=0, shiftk=0 0 0 (to include gamma) and taking output kpt set
# file as qpt set. Set nstep=1 so only one iteration runs.

     nqpt   1            # One qpt for each dataset (only 0 or 1 allowed)
                         # This is the default for all datasets and must
                         #  be explicitly turned off for dataset 1.

     qpt2   0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
     qpt3   0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
     qpt4   2.50000000E-01  0.00000000E+00  0.00000000E+00
     qpt5   5.00000000E-01  0.00000000E+00  0.00000000E+00
     qpt6   2.50000000E-01  2.50000000E-01  0.00000000E+00
     qpt7   2.50000000E-01  2.50000000E-01  2.50000000E-01
     qpt8  -2.50000000E-01  2.50000000E-01  2.50000000E-01
     qpt9   5.00000000E-01  5.00000000E-01  2.50000000E-01
     qpt10  5.00000000E-01  5.00000000E-01  5.00000000E-01
#Set 2 : Response function calculation of d/dk wave function
#
    iscf2   -3         # Need this non-self-consistent option for d/dk
  kptopt2   3          # Modify default to use time-reversal symmetry
  rfphon2   0          # Cancel default
  rfelfd2   2          # Calculate d/dk wave function only
  tolwfr2   1.0d-20    # Use wave function residual criterion instead

#Set 3 : Response function calculation of Q=0 phonons and electric field pert.

  getddk3   2          # d/dk wave functions from last dataset
  kptopt3   3          # Modify default to use time-reversal symmetry
  rfelfd3   3          # Electric-field perturbation response only

#Sets 4-10 : Finite-wave-vector phonon calculations (defaults for all datasets)

   getwfk   1          # Use GS wave functions from dataset1
   kptopt   3          # Need full k-point set for finite-Q response
   rfphon   1          # Do phonon response
  rfatpol   1 4        # Treat displacements of all atoms
    rfdir   1 1 1      # Do all directions (symmetry will be used)
   tolvrs   1.0d-18     # This default is active for sets 3-10
  prepgkk 1 # force all perturbations to be calculated for q-points considered
  prtgkk 1 # print out GKK files containing electron-phonon coupling
#######################################################################
#Common input variables

#Definition of the unit cell
acell       3*4.8598031174E+00
            rprim     -5.7735026919E-01  5.7735026919E-01  5.7735026919E-01
                       5.7735026919E-01 -5.7735026919E-01  5.7735026919E-01
                       5.7735026919E-01  5.7735026919E-01 -5.7735026919E-01
#Definition of the atom types
   ntypat   2         # There are two types of atom
    znucl   1 16     # The keyword "znucl" refers to the atomic number of the
                      # possible type(s) of atom. The pseudopotential(s)
                      # mentioned in the "files" file must correspond
                      # to the type(s) of atom. Here, type 1 is the Aluminum,
                      # type 2 is the Arsenic.

#Definition of the atoms
    natom   4         # There are two atoms
    typat   1 1 1 2       # The first is of type 1 (Al), the second is of type 2 (As).
                       
     xred   5.0000000000E-01  5.0000000000E-01  0.0000000000E+00
            0.0000000000E+00  5.0000000000E-01  5.0000000000E-01
            5.0000000000E-01  0.0000000000E+00  5.0000000000E-01
            0.0000000000E+00  0.0000000000E+00  0.0000000000E+00
              

#Gives the number of band, explicitely (do not take the default)
    nband   15         

#Exchange-correlation functional


#Definition of the planewave basis set

     ecut   35.0           # Maximal kinetic energy cut-off, in Hartree

#Definition of the k-point grid
    ngkpt   24  24  24         
  nshiftk   1              # Use one copy of grid only (default)
   shiftk   0.0 0.0 0.0    # This gives the usual fcc Monkhorst-Pack grid
            
            
            

#Definition of the SCF procedure
     iscf   7          # Self-consistent calculation, using algorithm 5
    nstep   100000         # Maximal number of SCF cycles
  # diemac   9.0        # Although this is not mandatory, it is worth to
                       # precondition the SCF cycle. The model dielectric
                       # function used as the standard preconditioner
                       # is described in the "dielng" input variable section.
                       # The dielectric constant of AlAs is smaller that the one of Si (=12).
# add to conserve old < 6.7.2 behavior for calculating forces at each SCF step
optforces 1
~~~~(&gt;_&lt;)~~~~
2楼2016-06-06 13:08:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

diandianer

铜虫 (初入文坛)

teph_5.in:
# turn on calculation of the electron-phonon quantities
elphflag 1

telphint 0

# Minimalistic kpoint grid - needed for tetrahedron method
kptrlatt 24 0 0  0 24 0  0 0 24

mustar 0.1
nqpath 6         
qpath            
0.0 0.0 0.0     #G
1/2 1/2 1/2     #H   
0.0 0.0 1/2     #N
1/4 1/4 1/4     #P
0.0 0.0 0.0     #G
0.0 0.0 1/2     #N

prtdos  1
ng2qpt 12 12 12
prtnest 1                                             

# Minimalistic qpoint grid
ngqpt 4 4 4

#  impose acoustic sum rule in a symmetric way
asr 2
dipdip 1

#  bravais lattice necessary
brav 3

# qpt grid
nqshft 1
q1shft 0.0 0.0 0.0
#
ifcflag 1
ifcana 1
#  ifc for all atoms?
natifc 4
atifc 1 2 3 4

#  print dielectric matrix with freq dependence
dieflag 0

#  print out eigenvectors and symmetrize dyn matrix
eivec 1

#Wavevector list number 1 (Reduced coordinates and normalization factor)
nph1l 26
qph1l

  0.000000  0.000000  0.000000  1.00
  0.100000 -0.100000  0.100000  1.00
  0.200000 -0.200000  0.200000  1.00
  0.300000 -0.300000  0.300000  1.00
  0.400000 -0.400000  0.400000  1.00
  0.500000 -0.500000  0.500000  1.00
  0.400000 -0.400000  0.500000  1.00
  0.300000 -0.300000  0.500000  1.00
  0.200000 -0.200000  0.500000  1.00
  0.100000 -0.100000  0.500000  1.00
  0.000000 -0.000000  0.500000  1.00
  0.050000  0.050000  0.450000  1.00
  0.100000  0.100000  0.400000  1.00
  0.150000  0.150000  0.350000  1.00
  0.200000  0.200000  0.300000  1.00
  0.250000  0.250000  0.250000  1.00
  0.200000  0.200000  0.200000  1.00
  0.150000  0.150000  0.150000  1.00
  0.100000  0.100000  0.100000  1.00
  0.050000  0.050000  0.050000  1.00
  0.000000 -0.000000  0.000000  1.00
  0.000000 -0.000000  0.100000  1.00
  0.000000 -0.000000  0.200000  1.00
  0.000000 -0.000000  0.300000  1.00
  0.000000 -0.000000  0.400000  1.00
  0.000000 -0.000000  0.500000  1.00
# This line added when defaults were changed (v5.3) to keep the previous, old behaviour
  #symdynmat 0
~~~~(&gt;_&lt;)~~~~
3楼2016-06-06 13:12:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

diandianer

铜虫 (初入文坛)

log_5:

.Version 7.10.5 of ANADDB
.(MPI version, prepared for a x86_64_linux_intel12.1 computer)

.Copyright (C) 1998-2014 ABINIT group .
ANADDB comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
It is free software, and you are welcome to redistribute it
under certain conditions (GNU General Public License,
see ~abinit/COPYING or http://www.gnu.org/copyleft/gpl.txt).

ABINIT is a project of the Universite Catholique de Louvain,
Corning Inc. and other collaborators, see ~abinit/doc/developers/contributors.txt .
Please read ~abinit/doc/users/acknowledgments.html for suggested
acknowledgments of the ABINIT effort.
For more information, see http://www.abinit.org .

.Starting date : Wed  1 Jun 2016.
- ( at 13h48 )
  
  Give name for      formatted input file :
-   teph_5.in
  Give name for     formatted output file :
-   teph_5.out
  Give name for input derivative database :
-   teph_2.ddb.out
  Give name for output molecular dynamics :
-   teph_band2eps
  Give name for input elphon matrix elements  (GKK file) :
-   teph_3o_GKK.bin
  Give root name for elphon output files :
-   Temperature.out
  Give name for file containing ddk filenames for elphon/transport :
-   teph__ddk
-begin at tcpu      0.001  and twall      0.000 sec
inprep8 : open file teph_2.ddb.out
  inprep8 : nband(1)=          15
        occ  0.20000000000000D+01  0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00
             0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00
             0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00
             0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00
             0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00
-instrng :   129 lines of input have been read from file teph_5.in


================================================================================

-outvars_anaddb: echo values of input variables ----------------------

Flags :
     ifcflag         1
    elphflag         1
Miscellaneous information :
       eivec         1
         asr         2
Interatomic Force Constants Inputs :
      dipdip         1
      ifcana         1
      ifcout         0
      natifc         4
       atifc         1         2         3         4
Description of grid 1 :
        brav         3
       ngqpt         4         4         4
      nqshft         1
      q1shft
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
Phonon DOS information :
   dosdeltae  4.55633525E-06
    dossmear  2.27816763E-05
Description of grid 2 for Fourier interpolation :
      ng2qpt        12        12        12
      ngrids         4
      q2shft         0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
Elphon calculation will be carried out
   elphsmear    0.100000E-01
    a2fsmear    0.200000E-04
      mustar    0.100000E+00
      nqpath         6
       qpath
                0.000000E+00     0.000000E+00     0.000000E+00
                0.500000E+00     0.500000E+00     0.500000E+00
                0.000000E+00     0.000000E+00     0.500000E+00
                0.250000E+00     0.250000E+00     0.250000E+00
                0.000000E+00     0.000000E+00     0.000000E+00
                0.000000E+00     0.000000E+00     0.500000E+00
    telphint         0
Tetrahedron integration for elphon
    kptrlatt 24   0   0     0  24   0     0   0  24
Will output nesting factor
First list of wavevector (reduced coord.) :
       nph1l        26
       qph1l
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00    1.000E+00
                     1.00000000E-01 -1.00000000E-01  1.00000000E-01    1.000E+00
                     2.00000000E-01 -2.00000000E-01  2.00000000E-01    1.000E+00
                     3.00000000E-01 -3.00000000E-01  3.00000000E-01    1.000E+00
                     4.00000000E-01 -4.00000000E-01  4.00000000E-01    1.000E+00
                     5.00000000E-01 -5.00000000E-01  5.00000000E-01    1.000E+00
                     4.00000000E-01 -4.00000000E-01  5.00000000E-01    1.000E+00
                     3.00000000E-01 -3.00000000E-01  5.00000000E-01    1.000E+00
                     2.00000000E-01 -2.00000000E-01  5.00000000E-01    1.000E+00
                     1.00000000E-01 -1.00000000E-01  5.00000000E-01    1.000E+00
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  5.00000000E-01    1.000E+00
                     5.00000000E-02  5.00000000E-02  4.50000000E-01    1.000E+00
                     1.00000000E-01  1.00000000E-01  4.00000000E-01    1.000E+00
                     1.50000000E-01  1.50000000E-01  3.50000000E-01    1.000E+00
                     2.00000000E-01  2.00000000E-01  3.00000000E-01    1.000E+00
                     2.50000000E-01  2.50000000E-01  2.50000000E-01    1.000E+00
                     2.00000000E-01  2.00000000E-01  2.00000000E-01    1.000E+00
                     1.50000000E-01  1.50000000E-01  1.50000000E-01    1.000E+00
                     1.00000000E-01  1.00000000E-01  1.00000000E-01    1.000E+00
                     5.00000000E-02  5.00000000E-02  5.00000000E-02    1.000E+00
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00    1.000E+00
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  1.00000000E-01    1.000E+00
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  2.00000000E-01    1.000E+00
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  3.00000000E-01    1.000E+00
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  4.00000000E-01    1.000E+00
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  5.00000000E-01    1.000E+00

================================================================================

read the DDB information and perform some checks

-begin at tcpu      0.037  and twall      0.286 sec

inprep8 : open file teph_2.ddb.out
  inprep8 : nband(1)=          15
        occ  0.20000000000000D+01  0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00
             0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00
             0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00
             0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00
             0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00  0.00000000000000D+00
About to open file teph_2.ddb.out
Unit cell volume ucvol=  8.9538391E+01 bohr^3
Angles (23,13,12)=  1.09471221E+02  1.09471221E+02  1.09471221E+02 degrees
   1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  3  3  3  3  3  3  3  3
   2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  3  3  3  3  3  3  3  3
   2  2  2  2  2  2  2  2  3  3  3  3  3  3  3  3  1  1  1  1  1  1  1  1
   1  1  1  1  1  1  1  1  3  3  3  3  3  3  3  3  2  2  2  2  2  2  2  2
   3  3  3  3  3  3  3  3  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2
   3  3  3  3  3  3  3  3  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1
   4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4
   4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4


rdddb9 : read     8 blocks from the input DDB
Now the whole DDB is in central memory
   1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  3  3  3  3  3  3  3  3
   2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  3  3  3  3  3  3  3  3
   2  2  2  2  2  2  2  2  3  3  3  3  3  3  3  3  1  1  1  1  1  1  1  1
   1  1  1  1  1  1  1  1  3  3  3  3  3  3  3  3  2  2  2  2  2  2  2  2
   3  3  3  3  3  3  3  3  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2  2
   3  3  3  3  3  3  3  3  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1
   4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4
   4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4  4
gtblk9: enter gtblk9
gtblk9: found block number 1 agree with specifications

================================================================================

Dielectric Tensor and Effective Charges


anaddb : Zero the imaginary part of the Dynamical Matrix at Gamma,
   and impose the ASR on the effective charges

Now, the imaginary part of the dynamical matrix is zeroed

Dielectric Tensor
    6.473971E+05    3.921227E-10    2.931392E-10
    3.921227E-10    6.473971E+05    2.931392E-10
    1.307076E-10    3.921227E-10    6.473971E+05

Effectives Charges
atom    1   -3.027829E-01   -5.551115E-16   -1.665335E-16
   -7.216450E-16   -3.027829E-01    1.665335E-16
    7.771561E-16    6.106227E-16    2.874878E+00
atom    2    2.874878E+00    6.106227E-16    7.771561E-16
    1.665335E-16   -3.027829E-01   -7.216450E-16
   -1.665335E-16   -6.106227E-16   -3.027829E-01
atom    3   -3.027829E-01    0.000000E+00   -7.216450E-16
    7.771561E-16    2.874878E+00    7.771561E-16
   -7.771561E-16    0.000000E+00   -3.027829E-01
atom    4   -2.818765E-01    0.000000E+00    1.022555E-20
    0.000000E+00   -2.818765E-01    1.022555E-20
    0.000000E+00    0.000000E+00   -2.818765E-01

================================================================================

Calculation of the interatomic forces

-begin at tcpu      0.071  and twall      0.336 sec
       Body-Centered Lattice Grid
mkifc9 : will extract the dipole-dipole part,
using ewald9, q0dy3 and nanal9 for every wavevector.
~~~~(&gt;_&lt;)~~~~
4楼2016-06-06 13:13:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

diandianer

铜虫 (初入文坛)

teph_5.out:

.Version 7.10.5 of ANADDB
.(MPI version, prepared for a x86_64_linux_intel12.1 computer)

.Copyright (C) 1998-2014 ABINIT group .
ANADDB comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
It is free software, and you are welcome to redistribute it
under certain conditions (GNU General Public License,
see ~abinit/COPYING or http://www.gnu.org/copyleft/gpl.txt).

ABINIT is a project of the Universite Catholique de Louvain,
Corning Inc. and other collaborators, see ~abinit/doc/developers/contributors.txt .
Please read ~abinit/doc/users/acknowledgments.html for suggested
acknowledgments of the ABINIT effort.
For more information, see http://www.abinit.org .

.Starting date : Wed  1 Jun 2016.
- ( at 13h48 )
  

================================================================================

-outvars_anaddb: echo values of input variables ----------------------

Flags :
     ifcflag         1
    elphflag         1
Miscellaneous information :
       eivec         1
         asr         2
Interatomic Force Constants Inputs :
      dipdip         1
      ifcana         1
      ifcout         0
      natifc         4
       atifc         1         2         3         4
Description of grid 1 :
        brav         3
       ngqpt         4         4         4
      nqshft         1
      q1shft
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
Phonon DOS information :
   dosdeltae  4.55633525E-06
    dossmear  2.27816763E-05
Description of grid 2 for Fourier interpolation :
      ng2qpt        12        12        12
      ngrids         4
      q2shft         0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
Elphon calculation will be carried out
   elphsmear    0.100000E-01
    a2fsmear    0.200000E-04
      mustar    0.100000E+00
      nqpath         6
       qpath
                0.000000E+00     0.000000E+00     0.000000E+00
                0.500000E+00     0.500000E+00     0.500000E+00
                0.000000E+00     0.000000E+00     0.500000E+00
                0.250000E+00     0.250000E+00     0.250000E+00
                0.000000E+00     0.000000E+00     0.000000E+00
                0.000000E+00     0.000000E+00     0.500000E+00
    telphint         0
Tetrahedron integration for elphon
    kptrlatt 24   0   0     0  24   0     0   0  24
Will output nesting factor
First list of wavevector (reduced coord.) :
       nph1l        26
       qph1l
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00    1.000E+00
                     1.00000000E-01 -1.00000000E-01  1.00000000E-01    1.000E+00
                     2.00000000E-01 -2.00000000E-01  2.00000000E-01    1.000E+00
                     3.00000000E-01 -3.00000000E-01  3.00000000E-01    1.000E+00
                     4.00000000E-01 -4.00000000E-01  4.00000000E-01    1.000E+00
                     5.00000000E-01 -5.00000000E-01  5.00000000E-01    1.000E+00
                     4.00000000E-01 -4.00000000E-01  5.00000000E-01    1.000E+00
                     3.00000000E-01 -3.00000000E-01  5.00000000E-01    1.000E+00
                     2.00000000E-01 -2.00000000E-01  5.00000000E-01    1.000E+00
                     1.00000000E-01 -1.00000000E-01  5.00000000E-01    1.000E+00
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  5.00000000E-01    1.000E+00
                     5.00000000E-02  5.00000000E-02  4.50000000E-01    1.000E+00
                     1.00000000E-01  1.00000000E-01  4.00000000E-01    1.000E+00
                     1.50000000E-01  1.50000000E-01  3.50000000E-01    1.000E+00
                     2.00000000E-01  2.00000000E-01  3.00000000E-01    1.000E+00
                     2.50000000E-01  2.50000000E-01  2.50000000E-01    1.000E+00
                     2.00000000E-01  2.00000000E-01  2.00000000E-01    1.000E+00
                     1.50000000E-01  1.50000000E-01  1.50000000E-01    1.000E+00
                     1.00000000E-01  1.00000000E-01  1.00000000E-01    1.000E+00
                     5.00000000E-02  5.00000000E-02  5.00000000E-02    1.000E+00
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00    1.000E+00
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  1.00000000E-01    1.000E+00
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  2.00000000E-01    1.000E+00
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  3.00000000E-01    1.000E+00
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  4.00000000E-01    1.000E+00
                     0.00000000E+00  0.00000000E+00  5.00000000E-01    1.000E+00

================================================================================

read the DDB information and perform some checks

-begin at tcpu      0.037  and twall      0.286 sec

Real(R)+Recip(G) space primitive vectors, cartesian coordinates (Bohr,Bohr^-1):
R(1)= -2.8182732  2.8182732  2.8182732  G(1)=  0.0000000  0.1774136  0.1774136
R(2)=  2.8182732 -2.8182732  2.8182732  G(2)=  0.1774136  0.0000000  0.1774136
R(3)=  2.8182732  2.8182732 -2.8182732  G(3)=  0.1774136  0.1774136  0.0000000
Unit cell volume ucvol=  8.9538391E+01 bohr^3
Angles (23,13,12)=  1.09471221E+02  1.09471221E+02  1.09471221E+02 degrees
Now the whole DDB is in central memory

================================================================================

Dielectric Tensor and Effective Charges


anaddb : Zero the imaginary part of the Dynamical Matrix at Gamma,
   and impose the ASR on the effective charges

Effective charge tensors after
imposition of the charge neutrality,
and eventual restriction to some part :
   atom    displacement
         1         1   -3.027829E-01   -4.440892E-16    5.551115E-16
         1         2   -4.440892E-16   -3.027829E-01    5.551115E-16
         1         3    0.000000E+00    0.000000E+00    2.874878E+00
         2         1    2.874878E+00    0.000000E+00    0.000000E+00
         2         2    5.551115E-16   -3.027829E-01   -5.551115E-16
         2         3    5.551115E-16   -4.440892E-16   -3.027829E-01
         3         1   -3.027829E-01    5.551115E-16   -5.551115E-16
         3         2    0.000000E+00    2.874878E+00    0.000000E+00
         3         3   -4.440892E-16    5.551115E-16   -3.027829E-01
         4         1   -2.818765E-01    0.000000E+00    0.000000E+00
         4         2    0.000000E+00   -2.818765E-01    0.000000E+00
         4         3    0.000000E+00    0.000000E+00   -2.818765E-01
Now, the imaginary part of the dynamical matrix is zeroed

================================================================================

Calculation of the interatomic forces

-begin at tcpu      0.071  and twall      0.336 sec
       Homogeneous q point set in the B.Z.
Grid q points  :       16
  1)   0.00000000E+00  0.00000000E+00  0.00000000E+00
  2)  -2.50000000E-01  2.50000000E-01  2.50000000E-01
  3)   2.50000000E-01 -2.50000000E-01 -2.50000000E-01
  4)   2.50000000E-01 -2.50000000E-01  2.50000000E-01
  5)   0.00000000E+00  0.00000000E+00  5.00000000E-01
  6)   5.00000000E-01 -5.00000000E-01  0.00000000E+00
  7)  -2.50000000E-01  2.50000000E-01 -2.50000000E-01
  8)   2.50000000E-01  2.50000000E-01 -2.50000000E-01
  9)   0.00000000E+00  5.00000000E-01  0.00000000E+00
10)   5.00000000E-01  0.00000000E+00 -5.00000000E-01
11)   5.00000000E-01  0.00000000E+00  0.00000000E+00
12)   2.50000000E-01  2.50000000E-01  2.50000000E-01
13)   7.50000000E-01 -2.50000000E-01 -2.50000000E-01
14)   0.00000000E+00  5.00000000E-01 -5.00000000E-01
15)   5.00000000E-01  5.00000000E-01 -5.00000000E-01
16)  -2.50000000E-01 -2.50000000E-01  2.50000000E-01
~~~~(&gt;_&lt;)~~~~
5楼2016-06-06 13:15:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

obaica

禁言 (著名写手)

本帖内容被屏蔽

6楼2016-06-06 16:18:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hisap-nano

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果ddb合并没有问题的话,后面声子譜的计算应该没有问题。有的时候abinit没有编译好也会有问题,你可以问一下管理员。或者在自己的电脑上把软件编译后跑一下,我觉得你有合并好的ddb文件后面的计算不需要太多的资源
7楼2016-06-08 17:51:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tong95

铜虫 (小有名气)

你这个要等一会 我也遇到这个问题了 它是运算比较慢 并没有错误

发自小木虫IOS客户端
8楼2017-05-05 12:01:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 diandianer 的主题更新
信息提示
请填处理意见