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jolinluo

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】Amorphous Cell构建带苯环刚性聚合物链体系

我要键的高分子链是很多苯环的刚性体系。amorphous cell constuction过程中报错,检查*.acclog文件的提示为: Catenation or spearing found
       就是在建立链的过程中,出现了苯环穿越或者刺穿其他苯环才能保持链的连续性的情况。我现在把初始密度降到足够低0.1g/cc,并且在preferences tab中将dynamic steps = 10000, minimazation steps = 8000, 还是会报错。请问有经验的高手,除此外哪些参数可以调节从而顺利建好一条刚性链。非常感谢

[ Last edited by lei0736 on 2008-11-4 at 22:02 ]
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yuerainsea

★ ★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
zxzj05(金币+2,VIP+0):3Q! ^_^ 多多支持! 5-26 11:46
你看的那个文献我也看过,我个人认为不是说之前加入10个甲烷分子,而是建的时候加入10个或100个甲烷分子,造成阻碍。我做的分子也有苯环和双键,我用这种方法还是失败。不过你还是可以试试。另外,可以调节一下建盒子的参数,比如lookahead bond之类的,还有就是我发现有的时候成功,有的时候失败,不知道和软件的稳定性有什么关系,还是聚合物构象相关
4楼2008-11-03 09:28:58
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