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半仙0356

新虫 (正式写手)

[求助] 反转录和PCR问题╭(°A°`)╮ 已有2人参与

自己提的RNA,浓度1500左右.OD值1.90,用thermo的反转录盒子,先加8.5μLDEPC水,3μLRNA模板,1μL随机引物,65度5分钟后,再加入buffer4μL,dNTP 2μL,酶1μL,酶抑制剂0.5μl,42度2小时,70度10分钟,然后用actin和GAPDH内参PCR,Tm值分别为57/59度,但是电泳后啥也没有,怎么回事儿啊?求解~




@biostar2009 @wizardfan 发自小木虫Android客户端
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瘸腿老马

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
半仙0356: 金币+5, 有帮助 2016-05-29 16:58:43
每一步都有可能导致RT-PCR失败,没有对照谁也不知道是什么原因,把所有对照做一下才好说。
2楼2016-05-24 06:51:02
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jackyoung

新虫 (正式写手)


myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰·手有余香,谢谢你的理解与支持。祝您科研顺利,文章多多。 2016-05-26 17:48:03
首先你得有个引物正确括增出来的正对照,做实验不放对照都是耍流氓,让我们没法猜;
看你的体系,RNA如果是NanoDrop测定的话,1500左右的单位是什么?ug / ml或等价的ng/ul ?还是其它?如果是的话,你的RNA用量有点儿高。还有对于随机引物的描述不理解,如果是随机引物我们的反转录条件不是这样,是不是混合引物(6-mer随机引物+Oligo dT)?65℃后冰上的chill呢?

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CestLaVie
3楼2016-05-24 06:51:47
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半仙0356

新虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jackyoung at 2016-05-24 06:51:47
首先你得有个引物正确括增出来的正对照,做实验不放对照都是耍流氓,让我们没法猜;
看你的体系,RNA如果是NanoDrop测定的话,1500左右的单位是什么?ug / ml或等价的ng/ul ?还是其它?如果是的话,你的RNA用量有点儿 ...

不好意思~浓度单位是ng/μl,引物是随机六聚体引物~以前这么做都成功了,但是最近两次都没出结果~谢谢

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4楼2016-05-24 07:49:52
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mlxmiao

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 半仙0356 at 2016-05-24 07:49:52
不好意思~浓度单位是ng/μl,引物是随机六聚体引物~以前这么做都成功了,但是最近两次都没出结果~谢谢
...

电泳去检测一下RNA质量

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5楼2016-05-25 07:17:07
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804371539

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰·手有余香,谢谢你的理解与支持。祝您科研顺利,文章多多。 2016-05-26 17:48:15
觉得RNA质量这么高有点诡异啊。
6楼2016-05-25 07:57:55
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半仙0356

新虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by mlxmiao at 2016-05-25 07:17:07
电泳去检测一下RNA质量
...

这就是电泳的结果~
-1



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7楼2016-05-26 14:00:34
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mlxmiao

木虫 (著名写手)

检查下,PCR可能有哪一步弄错了,引物等

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8楼2016-05-26 17:01:33
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半仙0356

新虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by mlxmiao at 2016-05-26 17:01:33
检查下,PCR可能有哪一步弄错了,引物等

没有啊,同样的东西,我用以前反转录的cDNA就能出条带╭(°A°`)╮

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9楼2016-05-26 18:46:17
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恶魔戒指

金虫 (小有名气)

怒力 ~~
10楼2016-05-26 21:52:44
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