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郑倩_smile

铁虫 (初入文坛)

[求助] 全基因组重测序定位突变位点

各位虫友,
我现在想通过基因组重测序找到一个突变位点。具体方法是这样的:以拟南芥一个矮化突变体(Ws)为背景进行EMS突变,得到了一个表型恢复(变高)的双突变体,现在要定位这个突变基因。双突先和Col杂交,F1代种下去,收集矮化的植株个体,继续种下去收集F3代表型恢复的个体,我收集了100株,混合样品DNA,打算通过全基因组重测序定位这个突变位点的位置。打算在诺禾致源测序,和公司的技术人员沟通他们说全测序会找到很多个突变位点,建议BSA方法测序。但是我认为F3代中表型恢复的个体中全部都含有我想要找的这个位点的突变,而其他无义突变则通过杂交、表型筛选,多样本能够消除遗传背景差异,排除掉那些与形状无关的突变。
不知道有谁做过这方面的测序,能不能说一说你们是怎么做的?
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炒饭达人

木虫 (初入文坛)

如果能够比较确定突变的位点情况,全基因组测序也可以做的
2楼2016-06-01 17:11:04
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dflovery

新虫 (初入文坛)

BSA找出的是一个区段,里面包含很多snp位点,区段足够小的话待选基因数目可能也会最后少。

发自小木虫IOS客户端
3楼2018-05-10 02:06:56
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