版块导航: 正在加载中...

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

>论坛更新日志 (4920)
>虫友互识 (1335)
>基金申请 (706)
>文献求助 (421)
>导师招生 (384)
>论文投稿 (214)
>博后之家 (206)
>硕博家园 (159)
>考博 (108)
>休闲灌水 (105)
>考研 (70)
>留学DIY (55)
>教师之家 (51)
>公派出国 (46)
>招聘信息布告栏 (39)
>找工作 (32)

返回列表

fanggeyuanye

银虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 211
散金: 10
帖子: 44
在线: 31.3小时
虫号: 3087035
注册: 2014-03-25
性别: MM
专业: 环境污染化学

[求助] gromacs加电场求教已有1人参与

刚开始学习用gromacs，菜鸟一名，在模拟体系中添加电场的一些问题，跪求大神指点。
根据mdp文件我找到添加电场指令如下：
；Electric fields                                                    =
; Format is number of terms (int) and for all terms an amplitude (real) =
; and a phase angel (real)                                           =
E-x                                                                   =
E-xt                                                                   =
E-y                                                                   =
E-yt                                                                   =
E-z                                                                   =
E-zt                                                                   =
这里面的electric  field  后面是不是填直流还是交流AC/DC?
format......后面是神马意思？
相位角需要填吗？这三个参数是注解的意思，我需要填写必须要的数据么？
E-x,  E-y,E-z  后面需要三个数字，第一个是余弦值一般为1，第二个是电场大小，第三个任意填对吗？
在gromacs官网里面看到E-xt，E-yt，E-zt 后面的注解是还没有应用，也就是说这几行不用输入吗？还是输入什么数字？
  求大神指点

回复此楼

» 猜你喜欢

努力就是结果

1楼 2016-05-18 08:42:06

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

jerkwin

专家顾问 (正式写手)

专家经验: +14
应助: 454 (硕士)
金币: 20659.1
散金: 148
红花: 81
帖子: 813
在线: 2648.7小时
虫号: 1023452
注册: 2010-05-19
专业: 理论和计算化学
管辖: 分子模拟

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fanggeyuanye: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢提供帮助 2016-06-02 16:34:40

http://jerkwin.github.io/GMX/GMXman-7/#section-22
请加下面的QQ群, 有人回答

赞一下