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fanggeyuanye

银虫 (初入文坛)

[求助] gromacs加电场求教 已有1人参与

刚开始学习用gromacs,菜鸟一名,在模拟体系中添加电场的一些问题,跪求大神指点。
根据mdp文件我找到添加电场指令如下:
;Electric fields                                                       =
; Format is number of terms (int) and for all terms an amplitude (real) =
; and a phase angel (real)                                              =
E-x                                                                     =
E-xt                                                                    =
E-y                                                                     =
E-yt                                                                    =
E-z                                                                     =
E-zt                                                                    =
这里面的electric  field  后面是不是填直流还是交流AC/DC?
format......后面是神马意思?
相位角需要填吗?    这三个参数是注解的意思,我需要填写必须要的数据么?
E-x,  E-y,E-z  后面需要三个数字,第一个是余弦值一般为1,第二个是电场大小,第三个任意填对吗?
在gromacs官网里面看到E-xt,E-yt,E-zt 后面的注解是还没有应用,也就是说这几行不用输入吗?还是输入什么数字?
  求大神指点
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
fanggeyuanye: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢提供帮助 2016-06-02 16:34:40
http://jerkwin.github.io/GMX/GMXman-7/#section-22
请加下面的QQ群, 有人回答
2楼2016-05-21 04:17:35
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