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汕头大学海洋科学接受调剂
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wufang1205

新虫 (小有名气)

[交流] 吸附的模拟计算

我想计算十八胺分子在氧化锆的(111)晶面的吸附,在DMOL3中计算不了,应该用什么软件计算,求各位大神帮忙
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坚持就是胜利
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

★ ★
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wufang1205: 金币+1 2016-05-13 17:47:09
试试分子力学模块 Forcite
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
2楼2016-05-13 16:46:53
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wufang1205

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2016-05-13 16:46:53
试试分子力学模块 Forcite

谢谢你,那这个模型怎么建立啊
坚持就是胜利
3楼2016-05-13 17:34:35
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月只蓝

主管区长 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by wufang1205 at 2016-05-13 17:34:35
谢谢你,那这个模型怎么建立啊...

跟在dmol3中模型差不多,可以适当增大盒子的尺寸。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
4楼2016-05-13 23:02:51
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leeflying

铜虫 (初入文坛)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
wufang1205: 金币+1 2016-05-16 09:26:42
搜搜关于相互作用能的文章,有forcite plus模块计算分子在晶面上的吸附

发自小木虫Android客户端
5楼2016-05-15 13:10:46
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wufang1205

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by leeflying at 2016-05-15 13:10:46
搜搜关于相互作用能的文章,有forcite plus模块计算分子在晶面上的吸附

那在forcite plus中参数是如何设置的呢?我计算有周期的,也有非周期的
坚持就是胜利
6楼2016-05-16 10:23:43
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wufang1205

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by leeflying at 2016-05-15 13:10:46
搜搜关于相互作用能的文章,有forcite plus模块计算分子在晶面上的吸附

forcite plus中changes 如何设置?谢谢你了
坚持就是胜利
7楼2016-05-16 11:01:23
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winxuan

铁虫 (初入文坛)

★ ★
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wufang1205: 金币+1 2016-05-16 17:36:55
做表面吸附如果要精确计算就不要用DMol3了,DMol3无法计算周期性结构的基组重叠误差。Forcite是分子力学模块,如果是粗略计算或者介观尺度的计算的话可以用。如果要精确计算还是用VASP或者CASTEP比较好。
8楼2016-05-16 15:26:03
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wufang1205

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by winxuan at 2016-05-16 15:26:03
做表面吸附如果要精确计算就不要用DMol3了,DMol3无法计算周期性结构的基组重叠误差。Forcite是分子力学模块,如果是粗略计算或者介观尺度的计算的话可以用。如果要精确计算还是用VASP或者CASTEP比较好。

嗯嗯,关键是我建的模型太大了,用CASTEP也算不了,如果用VASP的话,对这个不太懂,我看到文献上有用Amorphous Cell 计算的,前辈对这个了解吗?
坚持就是胜利
9楼2016-05-16 17:36:43
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leeflying

铜虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by wufang1205 at 2016-05-16 10:23:43
那在forcite plus中参数是如何设置的呢?我计算有周期的,也有非周期的...

是不是周期的与你建模过程有关,forcite是计算的

发自小木虫Android客户端
10楼2016-05-17 08:32:55
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