应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 计算石墨烯热导率平衡态，求助！
192/2返回列表上一页12
查看: 5340  |  回复: 18
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

引弓落月

银虫 (小有名气)
你的data文件能贴出来看看？是用msi2lmp转的吗？

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
11楼2016-05-16 07:56:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiezhou5322

银虫 (正式写手)
截断半径不能大于模型盒子最短边长的一半

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
每个人只能陪你走一段路程
12楼2016-05-16 18:23:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青春逍遥啊

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by brucefan at 2016-05-13 19:51:50
Hello,

I think you are using the Green-Kubo method. The problem of lammps is that the heat current (also called heat flux)
formula implemented in lammps is only correct of two-body potentials  ...

您好：
  感谢您详细的回答，不好意思，前段时间出去学习，一直没有机会回复。您的文章我会仔细阅读作为参考。
赞一下 回复此楼
13楼2016-05-19 19:32:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青春逍遥啊

新虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by alundilong at 2016-05-14 03:17:08
试着调整一下你的z方向simulation的长度吧，以前遇到过类似问题。

是的，我把z方向的真空层的厚度变大之后，问题得到了解决。谢谢您的指导。
赞一下 回复此楼
14楼2016-05-19 19:33:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青春逍遥啊

新虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by brucefan at 2016-05-14 16:26:42
上楼的回答可能能够解决你的报错问题。但应该要注意最后计算热导率所用的厚度。文献中一般用0.335纳米。然后还是要强调一次，这个方法的多体势计算在lammps中搞错了，要慎用。我想给lammps改正，但感觉工作量太大， ...

您说的文献不知道您现在是否还记得，我参考的一篇取得石墨烯厚度是1.42埃。您的意思是这个势函数是多体势，不适合在用lammps根据GK方程求热导率，那采用什么样的势函数会相对比较合适呢？如果用airebo势函数呢？或者说采用NEMD（非平衡分子动力学）来计算石墨烯的热导率更加合适？
赞一下 回复此楼
15楼2016-05-19 19:36:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brucefan

专家顾问 (著名写手)
引用回帖:
15楼: Originally posted by 青春逍遥啊 at 2016-05-19 19:36:38
您说的文献不知道您现在是否还记得，我参考的一篇取得石墨烯厚度是1.42埃。您的意思是这个势函数是多体势，不适合在用lammps根据GK方程求热导率，那采用什么样的势函数会相对比较合适呢？如果用airebo势函数呢？或 ...

Yes, someone uses 1.42 Angatrom, but most people use 3.35 Angstrom. You should state the value you choose when reporting your data. This is just a choice and is not important.

Yes, Green-Kubo in lammps with many-body potentials (such as Tersoff, Stillinger-Weber, REBO, AIREBO, ect) is WRONG and should NOT be used. You can find details in my paper:

http://journals.aps.org/prb/abstract/10.1103/PhysRevB.92.094301

Using NEMD is OK, because the heat current is added externally. But NEMD is very time-consuming if you want to extrapolate to the infinite-size limit.
赞一下 回复此楼
16楼2016-05-19 20:44:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青春逍遥啊

新虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by jiezhou5322 at 2016-05-16 18:23:28
截断半径不能大于模型盒子最短边长的一半

您好：谢谢您的回答，我在尝试着把box变大之后问题解决了，感谢。
赞一下 回复此楼
17楼2016-05-21 15:50:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青春逍遥啊

新虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 引弓落月 at 2016-05-16 07:56:47
你的data文件能贴出来看看？是用msi2lmp转的吗？

我是用的网上一个小办法，转到vasp转换了一下格式的。现在问题解决了，感谢您的回答。
赞一下 回复此楼
18楼2016-05-21 15:50:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青春逍遥啊

新虫 (小有名气)
引用回帖:
16楼: Originally posted by brucefan at 2016-05-19 20:44:59
Yes, someone uses 1.42 Angatrom, but most people use 3.35 Angstrom. You should state the value you choose when reporting your data. This is just a choice and is not important.

Yes, Green-Kubo in  ...

您好！感谢您细致的回答，给我很多帮助，我会好好看看您的这篇文章的。
赞一下 回复此楼
19楼2016-05-21 15:51:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 青春逍遥啊 的主题更新
192/2返回列表上一页12
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +8 苏东坡二世 2026-08-23 8/400 2026-08-28 14:41 by lkforward
[基金申请] 基金不中，共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +10 Kittylucky 2026-08-27 11/550 2026-08-28 10:45 by Kittylucky
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 国合现在查不到了吗？ +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭