24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 5065  |  回复: 18
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

青春逍遥啊

新虫 (小有名气)

[求助] 计算石墨烯热导率平衡态,求助! 已有2人参与

如题,我想用lammps计算石墨烯的平衡态热导率,我用ms建立16*16*1的石墨烯模型,边界条件如果是ppp,则运行没有问题,如果改为pps,则总是出现如下错误:
     cannot use neighbor bins -box size << cutoff   (../neighbor.cpp:1737)
按照lammps    error中的提示,显示

Cannot use neighbor bins - box size << cutoffToo many neighbor bins will be created. This typically happens when the simulation box is very small in some dimension, compared to the neighbor cutoff. Use the “nsq” style instead of “bin” style.


我尝试着将我的box设置大一点,从16*16*1改为50*50*1,可是错误依然存在。势函数采用的是tersoff势函数。


部分in文件如下:

units       metal
variable    T equal 300          # in K
variable    V equal vol          # in A^3
variable    dt equal 0.0005      # in ps
variable    p equal 100000     # correlation length
variable    s equal 1      # sample interval
variable    d equal $p*$s   # dump interval

# convert from LAMMPS real units to SI   # donot change this part

variable    kB equal 1.3806504e-23    # [J/K] Boltzmann
variable    eV2J equal 1.60217646e-19
variable    A2m equal 1.0e-10
variable    ps2s equal 1.0e-12
variable    convert equal ${eV2J}*${eV2J}/${ps2s}/${A2m}

# setup problem

#dimension    3
#boundary     p p p
#lattice      fcc 5.376 orient x 1 0 0 orient y 0 1 0 orient z 0 0 1

#region       box block 0 4 0 4 0 4
#create_box   1 box
#create_atoms 1 box
#mass         1 39.948
#pair_style   lj/cut 13.0
#pair_coeff   * * 0.010325 3.405
#timestep     ${dt}
#thermo       $d


# for reading data file

# read structure from data file

dimension    3
boundary     p p s
read_data         data.graphite

#potential function

pair_style  tersoff
pair_coeff * * SiC.tersoff Si
timestep     ${dt}
thermo       $d
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子动力学模拟

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你确定你的文件是模拟石墨烯的?怎么看上去是模拟氩的?晶格是fcc,质量是40?这不是石墨烯吧?

当然,即使你这里全都搞对了,你也得不到正确结果,因为lammps在这个问题上有严重错误。具体的细节我以后用电脑再说。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2016-05-13 18:17:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 19 个回答

brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

不好意思啊,我看错了。你这是部分文件,而且我说的那部分注释掉了。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2016-05-13 18:19:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青春逍遥啊

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by brucefan at 2016-05-13 18:19:05
不好意思啊,我看错了。你这是部分文件,而且我说的那部分注释掉了。

嗯啊,我是建的石墨烯,用data读出来的。不知道为什么出现这个错误。
5楼2016-05-13 19:08:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青春逍遥啊

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by brucefan at 2016-05-13 18:17:37
你确定你的文件是模拟石墨烯的?怎么看上去是模拟氩的?晶格是fcc,质量是40?这不是石墨烯吧?

当然,即使你这里全都搞对了,你也得不到正确结果,因为lammps在这个问题上有严重错误。具体的细节我以后用电脑再 ...

您说的严重错误是指?
6楼2016-05-13 19:09:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 22408 312求调剂 +8 门路摸摸 2026-04-14 8/400 2026-04-14 09:06 by lbsjt
[考研] 272分材料子求调剂 +41 Loy0361 2026-04-10 53/2650 2026-04-13 14:20 by 张zhihao
[考研] 化工学硕 285求调剂 +29 Wisjxn 2026-04-07 29/1450 2026-04-13 13:47 by floriea
[考研] 266调剂 +10 daya sun 2026-04-07 11/550 2026-04-13 10:12 by fenglj492
[材料工程] 材料调剂推荐 +9 蛋糕x2 2026-04-07 9/450 2026-04-13 09:07 by lhj2009
[考研] 一志愿华工085600 331分 +7 天下ww 2026-04-09 7/350 2026-04-13 09:01 by lhj2009
[考研] 一志愿中国科学院上海有机所,有机化学356分找调剂 +12 Nadiums 2026-04-09 12/600 2026-04-13 08:50 by lhj2009
[考研] 0831生医工第一轮调剂失败求助 +12 小熊睿睿_s 2026-04-11 16/800 2026-04-12 16:28 by 钰璞
[考研] 求调剂 +11 翩翩一书生 2026-04-09 11/550 2026-04-11 19:57 by 逆水乘风
[考研] 283求调剂 +22 那个噜子 2026-04-09 22/1100 2026-04-11 10:41 by 逆水乘风
[考研] 087100初试311求调剂 +4 任雅琴 2026-04-09 4/200 2026-04-11 10:33 by zhq0425
[考研] 311求调剂 +13 xyp想读书 2026-04-10 14/700 2026-04-11 09:41 by 猪会飞
[考研] 调剂 化学 307 +21 73372112 2026-04-09 23/1150 2026-04-10 23:53 by wj165256
[考研] 287求调剂 +15 Fnhc 2026-04-07 21/1050 2026-04-10 19:09 by chemisry
[考研] 265求调剂 +12 风说她早忘了 2026-04-10 13/650 2026-04-10 18:56 by chemisry
[考研] 301求调剂 +5 149. 2026-04-10 5/250 2026-04-10 15:45 by 柴小白
[考研] 293调剂 +25 yj1221 2026-04-08 26/1300 2026-04-10 15:02 by 柴小白
[考研] 085801 总分275 本科新能源 求调剂 +8 bradoner 2026-04-08 9/450 2026-04-09 13:43 by only周
[考研] 生物学328分求调剂 +9 闪电kkl 2026-04-08 10/500 2026-04-08 21:42 by liuhuiying09
[考研] 277、学硕,求调剂 数一104, +11 瓶子PZ 2026-04-07 12/600 2026-04-07 23:30 by 一只好果子?
信息提示
请填处理意见