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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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浅爱123

新虫 (初入文坛)

[求助] 求问gromacs里有什么命令可以计算分子数量随时间的变化? 已有1人参与

求问各位大神们,gromacs里有什么命令可以计算分子数量随时间的变化?@oxox6085
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浅爱123

新虫 (初入文坛)

2楼2016-05-11 18:30:24
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G、sir

木虫 (小有名气)

3楼2016-05-12 09:07:03
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G、sir

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
关键要看你要算什么

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4楼2016-05-12 09:07:38
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浅爱123

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by G、sir at 2016-05-12 09:07:38
关键要看你要算什么

我想算0<z<3nm间水分子的数量变化,用g_select语法要怎么写呢

发自小木虫Android客户端
5楼2016-05-13 17:33:40
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G、sir

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

看下-h,可以直接规定范围的resname SOL and z<0.3 and z>0

发自小木虫IOS客户端
6楼2016-05-13 18:02:18
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浅爱123

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by G、sir at 2016-05-13 18:02:18
看下-h,可以直接规定范围的resname SOL and z<0.3 and z>0

我输入resname SOL and z<0.3 and z>0之后,按ctrl+d,但没办法保存,这是为什么呀?

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7楼2016-05-13 19:12:23
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G、sir

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 浅爱123 at 2016-05-13 19:12:23
我输入resname SOL and z<0.3 and z>0之后,按ctrl+d,但没办法保存,这是为什么呀?
...

g_select -f npt.trr -s npt.tpr -n index.ndx -select "resname CL and z>0 and z<0" -os npt.xvg

多看看教程
8楼2016-05-13 23:40:28
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