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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 求助lammpsy运行出错的问题
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PlateauG

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助lammpsy运行出错的问题 已有1人参与

接触lammps时间不长。
瞎打瞎撞写了一个代码，如图1所示。然后cmd运行。中间出了几次错，都改过来了。最后运行到dump，出现error（如图2）却不知道如何修改。error显示dumping an atom property that isn't allocated(dump_custom.cpp:950)。查手册说The chosen atom style does not define the per-atom quantity being dumped（已选择的原子模式没有定义被输出的每个原子的数量？）.
不知道是不是少了什么步骤，在此麻烦各路大神看一看，该如何修改代码。谢谢！

求助lammpsy运行出错的问题
1.jpg


求助lammpsy运行出错的问题-1
2.jpg
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1楼 2016-05-10 20:54:24
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alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
PlateauG: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 谢谢！ 2016-05-13 01:35:17
引用回帖:
4楼: Originally posted by PlateauG at 2016-05-11 00:53:01
谢谢！现在运行的确没有error的提示了，但是运行结束仍然没有生成lammpstrj文件。这是怎么回事呢？

3.jpg

4.jpg
...

有用run的命令吗？
比如，
run 1
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5楼2016-05-11 21:36:50
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alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
把dump那行的mol去掉。因为你的atom_style为atomic，也就是说你的体系是单原子分子体系，该体系没有分子编号。
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2楼2016-05-11 03:23:28
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PlateauG

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by alundilong at 2016-05-11 03:23:28
把dump那行的mol去掉。因为你的atom_style为atomic，也就是说你的体系是单原子分子体系，该体系没有分子编号。

谢谢！

发自小木虫IOS客户端
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3楼2016-05-11 14:31:02
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PlateauG

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by alundilong at 2016-05-11 03:23:28
把dump那行的mol去掉。因为你的atom_style为atomic，也就是说你的体系是单原子分子体系，该体系没有分子编号。

谢谢！现在运行的确没有error的提示了，但是运行结束仍然没有生成lammpstrj文件。这是怎么回事呢？
求助lammpsy运行出错的问题-2
3.jpg


求助lammpsy运行出错的问题-3
4.jpg
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4楼2016-05-11 14:53:01
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