24小时热门版块排行榜    

查看: 1180  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

PlateauG

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助lammpsy运行出错的问题 已有1人参与

接触lammps时间不长。
瞎打瞎撞写了一个代码,如图1所示。然后cmd运行。中间出了几次错,都改过来了。最后运行到dump,出现error(如图2)却不知道如何修改。error显示dumping an atom property that isn't allocated(dump_custom.cpp:950)。查手册说The chosen atom style does not define the per-atom quantity being dumped(已选择的原子模式没有定义被输出的每个原子的数量?).
不知道是不是少了什么步骤,在此麻烦各路大神看一看,该如何修改代码。谢谢!

求助lammpsy运行出错的问题
1.jpg


求助lammpsy运行出错的问题-1
2.jpg
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

PlateauG

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by alundilong at 2016-05-11 03:23:28
把dump那行的mol去掉。因为你的atom_style为atomic,也就是说你的体系是单原子分子体系,该体系没有分子编号。

谢谢!现在运行的确没有error的提示了,但是运行结束仍然没有生成lammpstrj文件。这是怎么回事呢?
求助lammpsy运行出错的问题-2
3.jpg


求助lammpsy运行出错的问题-3
4.jpg

4楼2016-05-11 14:53:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把dump那行的mol去掉。因为你的atom_style为atomic,也就是说你的体系是单原子分子体系,该体系没有分子编号。
2楼2016-05-11 03:23:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

PlateauG

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by alundilong at 2016-05-11 03:23:28
把dump那行的mol去掉。因为你的atom_style为atomic,也就是说你的体系是单原子分子体系,该体系没有分子编号。

谢谢!

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-05-11 14:31:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
PlateauG: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 谢谢! 2016-05-13 01:35:17
引用回帖:
4楼: Originally posted by PlateauG at 2016-05-11 00:53:01
谢谢!现在运行的确没有error的提示了,但是运行结束仍然没有生成lammpstrj文件。这是怎么回事呢?

3.jpg

4.jpg
...

有用run的命令吗?
比如,
run 1
5楼2016-05-11 21:36:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国自然评审意见 +8 wangmingqi 2026-08-28 9/450 2026-08-28 20:57 by Tide man
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +13 晴天加油 2026-08-26 14/700 2026-08-28 18:36 by huagongfeihu
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金不中,共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +3 bud_bud 2026-08-27 6/300 2026-08-28 11:53 by bud_bud
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
信息提示
请填处理意见