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PlateauG

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助lammpsy运行出错的问题 已有1人参与

接触lammps时间不长。
瞎打瞎撞写了一个代码,如图1所示。然后cmd运行。中间出了几次错,都改过来了。最后运行到dump,出现error(如图2)却不知道如何修改。error显示dumping an atom property that isn't allocated(dump_custom.cpp:950)。查手册说The chosen atom style does not define the per-atom quantity being dumped(已选择的原子模式没有定义被输出的每个原子的数量?).
不知道是不是少了什么步骤,在此麻烦各路大神看一看,该如何修改代码。谢谢!

求助lammpsy运行出错的问题
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求助lammpsy运行出错的问题-1
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alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把dump那行的mol去掉。因为你的atom_style为atomic,也就是说你的体系是单原子分子体系,该体系没有分子编号。
2楼2016-05-11 03:23:28
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PlateauG

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by alundilong at 2016-05-11 03:23:28
把dump那行的mol去掉。因为你的atom_style为atomic,也就是说你的体系是单原子分子体系,该体系没有分子编号。

谢谢!

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-05-11 14:31:02
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PlateauG

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by alundilong at 2016-05-11 03:23:28
把dump那行的mol去掉。因为你的atom_style为atomic,也就是说你的体系是单原子分子体系,该体系没有分子编号。

谢谢!现在运行的确没有error的提示了,但是运行结束仍然没有生成lammpstrj文件。这是怎么回事呢?
求助lammpsy运行出错的问题-2
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求助lammpsy运行出错的问题-3
4.jpg

4楼2016-05-11 14:53:01
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alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
PlateauG: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 谢谢! 2016-05-13 01:35:17
引用回帖:
4楼: Originally posted by PlateauG at 2016-05-11 00:53:01
谢谢!现在运行的确没有error的提示了,但是运行结束仍然没有生成lammpstrj文件。这是怎么回事呢?

3.jpg

4.jpg
...

有用run的命令吗?
比如,
run 1
5楼2016-05-11 21:36:50
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