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行到水穷

新虫 (初入文坛)

[求助] pSG5质粒进行BamHI和BglII双酶切如何酶切完全? 已有1人参与

pSG5质粒上EcorI、BamHI和BglII三个酶切位点是连在一起的,GAATTCGGATCCAGATCT,现在我要做BamHI和BglII双酶切,用的NEB的内切酶双酶切2h,之后用T4 连接酶连接后得到的大量空载质粒,挑了16个菌都是空载,所以怀疑是不是由于酶切位点连在一起,对双酶切有影响,导致酶切不完全?不过,我也有怀疑T4连接体系配置有问题
看了论坛资料后说可以分别单酶切,把需要保护碱基长一点的酶先切,然后再切保护碱基短一点的,查到NEB这两个酶的保护碱基是这样的,好像如果只剩一个残基情况下都比较难切,请问这种情况下怎么办比较好呢?pSG5质粒进行BamHI和BglII双酶切如何酶切完全?
求大侠赐教啊
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kangaroo0513

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
第一,两个酶切位点离得这么近,很有可能只能切的开一个;
第二,即使都切开了,估计绝大多数也都是空载,因为,bamHi和Bglii它们是同尾酶!!即使使用了AP进行脱磷,你插入片段的正反也没法确定。
我有更改过酶切位点的pSG5,有需要的话站短我,留下你的q。。
2楼2016-05-07 21:23:52
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