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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 20金币求助解决AB类错误
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yym6

木虫 (正式写手)

[交流] 20金币求助解决AB类错误

本人是解晶体的新手，恳请高手帮忙解决以下错误，如有认为可以解决的高手请留下邮箱，我把数据发过去，非常感谢!


029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......       0.80
211_ALERT_2_A ADP of Atom O1'     is NPD .....................          ?
369_ALERT_2_A Long   C(sp2)-C(sp2) Bond  C6     -   C7     ...       1.66 Ang.
#==============================================================================
213_ALERT_2_B Atom O1      has ADP max/min Ratio .............       4.50 prola
230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    O1     -   C36     ..      10.00 su
331_ALERT_2_B Small Average Phenyl C-C Dist.   C18    -C23           1.36 Ang.
411_ALERT_2_B Short Inter H...H Contact  H4     ..  H5      ..       1.97 Ang.
411_ALERT_2_B Short Inter H...H Contact  H14    ..  H28A    ..       2.03 Ang.
431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact  Cl1    ..  S2      ..       3.21 Ang.
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1楼 2008-10-28 20:22:21
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yym6

木虫 (正式写手)
各位大虾，我在线急等啊，自己弄了很久了也不会弄，急切盼望有人帮忙啊
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2楼2008-10-28 20:54:34
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)
b错误中是不是有氢加的不对 好像HH距离太短了嘛~自己看看 我知道的也不多
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3楼2008-10-28 21:29:48
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
估计数据太差, 没救了.
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xi2004-emuch@163.com
4楼2008-10-28 23:01:42
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shenjian-2

铜虫 (小有名气)
211_ALERT_2_A ADP of Atom O1'     is NPD .....................          ?

O1'是无序的O吗？连O1‘都已经NPD了。
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5楼2008-10-29 08:27:45
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yym6

木虫 (正式写手)
回答shenjian-2:O'是无序的，分子中有个呋喃环，整个呋喃环都是无序的。
第三个a类错误中碳碳键长限制过了可是不知道为什么限制不管用?b类错误中第三个是由于苯环的键长问题，可是也限制不管用，不知道是不是我对命令不熟悉，用的不对还是就是有限制不管用的时候？
除了这些错误之外，其他的数据都很好啊。还请大家来给我指点一下
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6楼2008-10-29 20:37:24
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shenjian-2

铜虫 (小有名气)
试试加口令
simu 0.02 O1 O1'
delu 0.0-2 O1 O1'
不行就加口令
eadp O1 O1'

369_ALERT_2_A Long   C(sp2)-C(sp2) Bond  C6     -   C7     ...       1.66 Ang.
C6-C7的键长太长了。
也是无序的THF中的原子吗？固定一下键长试试。
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7楼2008-10-29 23:27:35
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yym6

木虫 (正式写手)
simu 0.02 O1 O1'
delu 0.0-2 O1 O1'和
eadp O1 O1'我刚才试过了，可是还是不管用？C6-C7键长我是用命令
DFIX 1.54  0.02  C6 C7限制的，可是也不管用。不知道是什么原因？难道是所有的命令都不听我的话？？？
还是有什么注意事项我不会用？
聆听各位指教！
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8楼2008-10-30 23:23:21
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pangz

金虫 (小有名气)
主要问题有三个：
1.晶体数据收集不全，晶体专业杂志不会收。
2.呋喃无序，需要尝试拆开，如果不能，不如对呋喃进行各向同性修正（O都非正定了，明显处理得不合适）
3.键过长有时也是无序造成的，需具体分析，不能太粗暴地限制。
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9楼2008-10-31 09:01:02
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
昨晚基本帮你解决了.
但
411_ALERT_2_B Short Inter H...H Contact  H4     ..  H5      ..       1.97 Ang.
431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact  Cl1    ..  S2      ..       3.21 Ang.

这两个还没有找到原因.
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xi2004-emuch@163.com
10楼2008-10-31 11:37:09
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