24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2289  |  回复: 6

ycqzl

木虫 (正式写手)

[求助] CentOS 6.5下安装Gromacs报错求助!!!谢谢!!! 已有1人参与

已经安装了CentOS6.5,为了不因为安装Gromacs出错导致重做系统,所以在虚拟机内安装Gromacs作为实验
安装步骤如下:
su root
密码

cd /usr/local
yum install gcc-c++
y
y
whereis gcc
显示gcc: /usr/bin/gcc /usr/lib/gcc /usr/libexec/gcc

/usr/share/man/man1/gcc.1.gz
which gcc
显示/usr/bin/gcc
gcc --version
显示gcc (GCC) 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-16)
Copyright (C) 2010 Free Software Foundation, Inc.
This is free software; see the source for copying conditions.  There is NO
warranty; not even for MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.
cd /home/ycq
cp gcc-6.1.0.tar.gz /usr/local
将gcc-6.1.0.tar.gz复制到/usr/local下
cp cmake-3.5.2.tar.gz /usr/local
将cmake-3.5.2.tar.gz复制到/usr/local下
cp openmpi-1.10.2.tar.gz /usr/local
将openmpi-1.10.2.tar.gz复制到/usr/local下
cp fftw-3.3.4.tar.gz /usr/local
将fftw-3.3.4.tar.gz复制到/usr/local下
cp gromacs-5.1.2.tar.gz /usr/local
将gromacs-5.1.2.tar.gz复制到/usr/local下

cd /usr/local
tar zxvf cmake-3.5.2.tar.gz
cd  cmake-3.5.2
./bootstrap
make
make install

cd /usr/local
tar xfz gromacs-5.1.2.tar.gz
cd gromacs-5.1.2
mkdir build
cd build
cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON
报错如下:
Remembering we are in dir "regressiontests/"
FTP response timeout
control connection looks dead
Closing connection 1
-- Configuring incomplete, errors occurred!
See also "/usr/local/gromacs-5.1.2/build/CMakeFiles/CMakeOutput.log".
See also "/usr/local/gromacs-5.1.2/build/CMakeFiles/CMakeError.log".
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

arixxl

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
ycqzl: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2016-04-30 22:23:17
-DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON 去掉就行了.
2楼2016-04-30 20:41:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ycqzl

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by arixxl at 2016-04-30 20:41:27
-DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON 去掉就行了.

谢谢!!!我去试试

发自小木虫Android客户端
3楼2016-04-30 22:19:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qyj2006

铁杆木虫 (小有名气)

就是这个的原因

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

明明白白我的心,寻找一份真感情!
4楼2016-05-02 04:54:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ycqzl

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by qyj2006 at 2016-05-02 04:54:06
就是这个的原因

谢谢!!!

发自小木虫Android客户端
5楼2016-05-02 10:38:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cuoce

木虫 (小有名气)

你好,我想用cygwin安装gromacs,安装过程如下:
将安装包拷贝到了home/xing里面;
tar xvzf cmake-3.6.2.tar.gz
cd cmake-3.6.2
./bootstrap

运行一段时间之后出现如下问题:
CMake Error: Could not find CMAKE_ROOT !!!
CMake has most likely not been installed correctly.
Modules directory not found in
/home/xing/cmake-3.6.2
CMake Error: Error executing cmake::LoadCache(). Aborting.

---------------------------------------------
Error when bootstrapping CMake:
Problem while running initial CMake
--------------------------------------
请问这个问题咋解决啊?
6楼2017-10-22 21:56:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

你好哈-

木虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by cuoce at 2017-10-22 21:56:13
你好,我想用cygwin安装gromacs,安装过程如下:
将安装包拷贝到了home/xing里面;
tar xvzf cmake-3.6.2.tar.gz
cd cmake-3.6.2
./bootstrap

运行一段时间之后出现如下问题:
CMake Error: Could not find ...

在build 下sudo 一下cmake 试试

发自小木虫IOS客户端
7楼2017-11-05 23:06:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ycqzl 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上本子正文33页,违规吗?会被低分嘛? +7 1234567wang 2026-05-17 8/400 2026-05-18 15:07 by gy116024
[基金申请] 今年审到国自然15份,谈谈感受 +16 国自然国社科中 2026-05-17 16/800 2026-05-18 14:58 by gy116024
[教师之家] 上海大学实验技术岗位非升即走 +8 嘻嘻哈哈乐呵呵 2026-05-15 8/400 2026-05-18 11:53 by ning312
[硕博家园] 考博自荐 +5 科研狗111 2026-05-13 6/300 2026-05-18 11:22 by 糊糊涂涂好
[硕博家园] 我在等一个没有答案的答案 +3 Love_MH 2026-05-17 3/150 2026-05-18 02:22 by 竹林孤影
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 ky2p12rrjj 2026-05-15 4/200 2026-05-17 19:47 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 xx7gd5zq4e 2026-05-15 6/300 2026-05-17 19:36 by Equinoxhua
[考博] 26/27博士推荐 +3 1木头人13949 2026-05-13 3/150 2026-05-17 09:41 by YuY66
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 v9tggjlwd0 2026-05-15 4/200 2026-05-17 08:06 by 11n4dfd8yn
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 cjf4bx70cj 2026-05-14 7/350 2026-05-17 06:55 by 11n4dfd8yn
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 k37jurhrau 2026-05-16 3/150 2026-05-17 01:25 by ue3ir18jc3
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ky2p12rrjj 2026-05-15 4/200 2026-05-17 00:57 by ue3ir18jc3
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ky2p12rrjj 2026-05-15 4/200 2026-05-17 00:50 by ue3ir18jc3
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 x0mp7owy2b 2026-05-15 4/200 2026-05-17 00:35 by ue3ir18jc3
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 x0mp7owy2b 2026-05-15 4/200 2026-05-17 00:25 by ue3ir18jc3
[有机交流] 求助2,4-二氯-5-嘧啶甲醛的合成方法 20+3 光吃不拉 2026-05-14 6/300 2026-05-16 19:46 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 x0mp7owy2b 2026-05-15 4/200 2026-05-16 17:45 by j6b2pdz07o
[有机交流] 求有机合成大神指点三硫酸乙烯酯(CAS:2793408-99-6)的合成路线 30+3 Leekmid 2026-05-13 10/500 2026-05-16 16:37 by czyzsu
[硕博家园] 申请博士 +3 呃?呃 2026-05-15 3/150 2026-05-16 11:01 by a4742549
[教师之家] 教学课件你会给同学吗 +8 硕士研究生吗 2026-05-13 8/400 2026-05-14 22:23 by 常规沥青
信息提示
请填处理意见