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ycqzl

木虫 (正式写手)

[求助] CentOS 6.5下安装Gromacs报错求助!!!谢谢!!! 已有1人参与

已经安装了CentOS6.5,为了不因为安装Gromacs出错导致重做系统,所以在虚拟机内安装Gromacs作为实验
安装步骤如下:
su root
密码

cd /usr/local
yum install gcc-c++
y
y
whereis gcc
显示gcc: /usr/bin/gcc /usr/lib/gcc /usr/libexec/gcc

/usr/share/man/man1/gcc.1.gz
which gcc
显示/usr/bin/gcc
gcc --version
显示gcc (GCC) 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-16)
Copyright (C) 2010 Free Software Foundation, Inc.
This is free software; see the source for copying conditions.  There is NO
warranty; not even for MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.
cd /home/ycq
cp gcc-6.1.0.tar.gz /usr/local
将gcc-6.1.0.tar.gz复制到/usr/local下
cp cmake-3.5.2.tar.gz /usr/local
将cmake-3.5.2.tar.gz复制到/usr/local下
cp openmpi-1.10.2.tar.gz /usr/local
将openmpi-1.10.2.tar.gz复制到/usr/local下
cp fftw-3.3.4.tar.gz /usr/local
将fftw-3.3.4.tar.gz复制到/usr/local下
cp gromacs-5.1.2.tar.gz /usr/local
将gromacs-5.1.2.tar.gz复制到/usr/local下

cd /usr/local
tar zxvf cmake-3.5.2.tar.gz
cd  cmake-3.5.2
./bootstrap
make
make install

cd /usr/local
tar xfz gromacs-5.1.2.tar.gz
cd gromacs-5.1.2
mkdir build
cd build
cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON
报错如下:
Remembering we are in dir "regressiontests/"
FTP response timeout
control connection looks dead
Closing connection 1
-- Configuring incomplete, errors occurred!
See also "/usr/local/gromacs-5.1.2/build/CMakeFiles/CMakeOutput.log".
See also "/usr/local/gromacs-5.1.2/build/CMakeFiles/CMakeError.log".
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arixxl

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
ycqzl: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2016-04-30 22:23:17
-DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON 去掉就行了.
2楼2016-04-30 20:41:27
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ycqzl

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by arixxl at 2016-04-30 20:41:27
-DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON 去掉就行了.

谢谢!!!我去试试

发自小木虫Android客户端
3楼2016-04-30 22:19:32
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qyj2006

铁杆木虫 (小有名气)

就是这个的原因

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

明明白白我的心,寻找一份真感情!
4楼2016-05-02 04:54:06
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ycqzl

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by qyj2006 at 2016-05-02 04:54:06
就是这个的原因

谢谢!!!

发自小木虫Android客户端
5楼2016-05-02 10:38:08
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cuoce

木虫 (小有名气)

你好,我想用cygwin安装gromacs,安装过程如下:
将安装包拷贝到了home/xing里面;
tar xvzf cmake-3.6.2.tar.gz
cd cmake-3.6.2
./bootstrap

运行一段时间之后出现如下问题:
CMake Error: Could not find CMAKE_ROOT !!!
CMake has most likely not been installed correctly.
Modules directory not found in
/home/xing/cmake-3.6.2
CMake Error: Error executing cmake::LoadCache(). Aborting.

---------------------------------------------
Error when bootstrapping CMake:
Problem while running initial CMake
--------------------------------------
请问这个问题咋解决啊?
6楼2017-10-22 21:56:13
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你好哈-

木虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by cuoce at 2017-10-22 21:56:13
你好,我想用cygwin安装gromacs,安装过程如下:
将安装包拷贝到了home/xing里面;
tar xvzf cmake-3.6.2.tar.gz
cd cmake-3.6.2
./bootstrap

运行一段时间之后出现如下问题:
CMake Error: Could not find ...

在build 下sudo 一下cmake 试试

发自小木虫IOS客户端
7楼2017-11-05 23:06:44
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