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双酶切后连接,一直失败
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荷岚102
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双酶切后连接,一直失败
已有3人参与
1.质粒上有两个相邻的酶切位点,分别是EcoR1、EcoRV,那么这两个位点可以切的开吗?我双酶切了一周,一直没有切开。
2.T载体上已经连接了一个400bp的片段A,片段A两端分别有EcoRV和Hind3,构建为A—T,现在用 EcoRV和 EcoR1双酶切A—T(两个酶切位点间隔31bp),然后再连接600bp左右的片段B,可是转化后菌液PCR一直克隆的是A—T上的片段,感觉好像没有连上B。
我重复了很多次,每次的转化子都是这样的情况,希望大神们给予帮助
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1楼
2016-04-24 22:25:50
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Eternity宇
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2016-04-25 07:45:23
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【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
会不会是发生了重组抑制或者是因为两种酶在空间上形成了抑制?建议你对载体进行酶切位点分析,然后在酶切的时候先用EcoR V消化一个小时后,再加入EcoR I继续消化。
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2016-04-25 11:12:02
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专业: 微生物生理与生物化学
ECORV好像是平末端吧,连接效率不如粘性末端,如果可以建议更换
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天空才是极限,我有信心飞的更高!
4楼
2016-04-26 08:31:48
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daiyuccc
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【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
两个酶切位点隔得太近确实不利于切开,建议一个一个酶的切,也可以测测你的 位点有没有问题
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5楼
2016-04-26 11:00:09
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荷岚102
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专业: 植物生理与生化
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5楼
:
Originally posted by
daiyuccc
at 2016-04-26 11:00:09
两个酶切位点隔得太近确实不利于切开,建议一个一个酶的切,也可以测测你的 位点有没有问题
测位点有没有问题?不是太懂
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6楼
2016-04-26 12:31:04
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娟恋幸福
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专业: 植物学研究的新技术、新方
我也遇到同样的情况好久了,快郁闷死了
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7楼
2016-04-26 23:47:07
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nanxiao13
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8楼
2016-04-27 02:06:40
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玉兔Jane
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专业: 作物分子育种
【答案】应助回帖
1、保护碱基是否合适?一般都还好吧。
2、酶切是否切开了?连接是否连上了?如果有别的载体也是酶切连接,可以一起做啊,如果成功了可以说明操作很好吧。 没有用过EcoRV,抱歉。
3、实在不行,可以考虑下同源重组的方法吗?
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9楼
2016-04-27 23:17:04
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你太善良
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注册: 2012-09-06
专业: 基因表达调控与表观遗传学
相临?隔了几个碱基?如果没有隔真的不好切,酶也要空间的
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10楼
2016-04-29 12:24:24
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