24小时热门版块排行榜    

查看: 3575  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

junfei_w

新虫 (小有名气)

[交流] DFT-D2结构优化出错,为什么呢?

请大牛帮我看下我的出错原因,我现在用DFT-D2计算有机杂化分子的结构优化,一直收敛不了,我将出错地方黏贴给大家看,OUTCAR结尾出现以下提示:
bond charge predicted
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
[cli_0]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0
[cli_5]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 5
[cli_2]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 2
[cli_3]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 3
[cli_1]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 1
[cli_11]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 11
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
[cli_6]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 6
[cli_13]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 13
[cli_12]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 12
[cli_10]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 10
[cli_4]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 4
[cli_9]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 9
[cli_8]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 8
[cli_7]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 7
[cli_15]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 15
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
[cli_14]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 14
rank 15 in job 1  Newton20_44833   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 15: return code 1
rank 14 in job 1  Newton20_44833   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 14: return code 1
rank 13 in job 1  Newton20_44833   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 13: return code 1
rank 12 in job 1  Newton20_44833   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 12: return code 1
另外,我的INTCAR为:
ENCUT = 400
ISTART=0                              
ICHARG=2                              
ISMEAR=1                              
SIGMA=0.2
ISYM=0
  

NSW=100
ISIF=3                                
IBRION=2                             
POTIM=0.5
EDIFF=1E-5                          
EDIFFG=1E-4

PREC=Accurate     

IVDW=1
#LUSE_VDW=.TRUE.
#AGGAC=0.0000
LVDW=.TRUE.
VDW_RADIUS=30.0
VDW_SCALING=0.75
VDW_S6=0.75
VDW_SR=1.00
VDW_D=20.0
VDW_C6=63.162 31.50 1.23 1.75 0.14
VDW_R0=1.9437 1.892 1.397  1.452 1.001
#LVDW_EWALD=.TRUE.

#GGA = MK
#PARAM1 = 0.1234
#PARAM2 = 1.0000
#LUSE_VDW = .TRUE.
#AGGAC = 0.0000

PSTRESS=0.0
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

抖抖豆豆

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不知道你的问题解决没,我今天也碰到了一个类似的问题,mpirun noticed process rank 33 with PID ....这样的问题,可能是内存不够,我就把任务放到一个节点上算,可以了,不知道有没有帮助

发自小木虫IOS客户端
work doesn't work without play
7楼2016-04-25 16:38:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答
2楼2016-04-24 15:54:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

抖抖豆豆

新虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
junfei_w: 金币+2 2016-04-25 08:16:50
看起来是MPI 并行计算的问题,不太懂,帮顶

发自小木虫IOS客户端
work doesn't work without play
3楼2016-04-24 16:25:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tsglss

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问,DFT+D的用法什么时候使用阿?就是他的使用范围?能不能用你做的例子呢?谢谢

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
做好自己
4楼2016-04-25 08:34:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +5 生物工程调剂 2026-03-17 9/450 2026-03-21 23:32 by zhujy1982
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿南大,0703化学,分数336,求调剂 +3 收到VS 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:42 by 学员8dgXkO
[考研] 311求调剂 +3 勇敢的小吴 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:40 by ColorlessPI
[考研] 306求调剂 +4 chuanzhu川烛 2026-03-18 4/200 2026-03-21 08:25 by laoshidan
[考研] 307求调剂 +10 冷笙123 2026-03-17 10/500 2026-03-21 01:54 by JourneyLucky
[考研] 材料专业求调剂 +6 hanamiko 2026-03-18 6/300 2026-03-21 00:24 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中南化学(0703)总分337求调剂 +8 niko- 2026-03-19 9/450 2026-03-20 21:57 by luoyongfeng
[考研] 290求调剂 +7 ^O^乜 2026-03-19 7/350 2026-03-20 21:43 by JourneyLucky
[考研] 材料学求调剂 +4 Stella_Yao 2026-03-20 4/200 2026-03-20 20:28 by ms629
[考研] 一志愿 南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕 +5 @taotao 2026-03-20 5/250 2026-03-20 20:16 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西安交通大学 学硕 354求调剂211或者双一流 +3 我想要读研究生 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:13 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工专硕调剂 +7 heming3743 2026-03-16 7/350 2026-03-20 19:31 by zhukairuo
[考研] 08工学调剂 +5 用户573181 2026-03-20 5/250 2026-03-20 15:47 by xia_2003
[考研] 材料与化工求调剂 +7 为学666 2026-03-16 7/350 2026-03-19 14:48 by 尽舜尧1
[考研] 085600材料与化工调剂 324分 +10 llllkkkhh 2026-03-18 12/600 2026-03-19 14:33 by llllkkkhh
[考研] 【同济软件】软件(085405)考研求调剂 +3 2026eternal 2026-03-18 3/150 2026-03-18 19:09 by 搏击518
[考研] 085601专硕,总分342求调剂,地区不限 +5 share_joy 2026-03-16 5/250 2026-03-18 14:48 by haxia
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
信息提示
请填处理意见