应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » DFT-D2结构优化出错，为什么呢？
141/2返回列表12下一页
查看: 3567  |  回复: 13
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

junfei_w

新虫 (小有名气)

[交流] DFT-D2结构优化出错，为什么呢？

请大牛帮我看下我的出错原因，我现在用DFT-D2计算有机杂化分子的结构优化，一直收敛不了，我将出错地方黏贴给大家看，OUTCAR结尾出现以下提示:
bond charge predicted
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
[cli_0]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0
[cli_5]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 5
[cli_2]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 2
[cli_3]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 3
[cli_1]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 1
[cli_11]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 11
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
[cli_6]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 6
[cli_13]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 13
[cli_12]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 12
[cli_10]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 10
[cli_4]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 4
[cli_9]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 9
[cli_8]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 8
[cli_7]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 7
[cli_15]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 15
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           1           1           1
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!
[cli_14]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 14
rank 15 in job 1  Newton20_44833   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 15: return code 1
rank 14 in job 1  Newton20_44833   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 14: return code 1
rank 13 in job 1  Newton20_44833   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 13: return code 1
rank 12 in job 1  Newton20_44833   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 12: return code 1
另外，我的INTCAR为：
ENCUT = 400
ISTART=0                              
ICHARG=2                              
ISMEAR=1                              
SIGMA=0.2
ISYM=0
  

NSW=100
ISIF=3                                
IBRION=2                             
POTIM=0.5
EDIFF=1E-5                          
EDIFFG=1E-4

PREC=Accurate     

IVDW=1
#LUSE_VDW=.TRUE.
#AGGAC=0.0000
LVDW=.TRUE.
VDW_RADIUS=30.0
VDW_SCALING=0.75
VDW_S6=0.75
VDW_SR=1.00
VDW_D=20.0
VDW_C6=63.162 31.50 1.23 1.75 0.14
VDW_R0=1.9437 1.892 1.397  1.452 1.001
#LVDW_EWALD=.TRUE.

#GGA = MK
#PARAM1 = 0.1234
#PARAM2 = 1.0000
#LUSE_VDW = .TRUE.
#AGGAC = 0.0000

PSTRESS=0.0
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2016-04-24 09:52:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

shaojunp

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主，我想请教一下C6跟R0怎么设置，是vasp手册里每类原子的C6乘以原子个数吗？
赞一下(1人) 回复此楼
10楼2016-08-30 20:43:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

蛋蛋小童鞋
顶

发自小木虫Android客户端
2楼2016-04-24 15:54:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

抖抖豆豆

新虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
junfei_w: 金币+2 2016-04-25 08:16:50
看起来是MPI 并行计算的问题，不太懂，帮顶

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
work doesn't work without play
3楼2016-04-24 16:25:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tsglss

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问，DFT+D的用法什么时候使用阿？就是他的使用范围？能不能用你做的例子呢？谢谢

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
做好自己
4楼2016-04-25 08:34:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

junfei_w

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by tsglss at 2016-04-25 08:34:25
请问，DFT+D的用法什么时候使用阿？就是他的使用范围？能不能用你做的例子呢？谢谢

我的体系需要考虑范德瓦尔斯作用，因此需要考虑对DFT修正，至于其它的杂化泛函，真心不懂啊，你可以看看手册，上面有说明的。
赞一下 回复此楼
5楼2016-04-25 09:43:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tsglss

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by junfei_w at 2016-04-25 09:43:32
我的体系需要考虑范德瓦尔斯作用，因此需要考虑对DFT修正，至于其它的杂化泛函，真心不懂啊，你可以看看手册，上面有说明的。...

是不是二维材料的就必须用D修正呢？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
做好自己
6楼2016-04-25 13:01:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

抖抖豆豆

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
不知道你的问题解决没，我今天也碰到了一个类似的问题，mpirun noticed process rank 33 with PID ....这样的问题，可能是内存不够，我就把任务放到一个节点上算，可以了，不知道有没有帮助

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
work doesn't work without play
7楼2016-04-25 16:38:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

junfei_w

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 抖抖豆豆 at 2016-04-25 16:38:30
不知道你的问题解决没，我今天也碰到了一个类似的问题，mpirun noticed process rank 33 with PID ....这样的问题，可能是内存不够，我就把任务放到一个节点上算，可以了，不知道有没有帮助
...

谢谢建议，明天再换着算算看，能加你QQ吗？忘以后多交流哈
赞一下 回复此楼
8楼2016-04-25 19:57:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

junfei_w

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by tsglss at 2016-04-25 13:01:08
是不是二维材料的就必须用D修正呢？
...

建议多看看相关文章里面的算法，里面会有说明。
赞一下 回复此楼
9楼2016-04-25 19:58:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 junfei_w 的主题更新
141/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 354求调剂 +4 Tyoumou 2026-03-18 7/350 2026-03-18 21:45 by Tyoumou
[考研] 321求调剂 +3 何润采123 2026-03-18 3/150 2026-03-18 21:27 by li123456789.
[考研] 0703化学调剂，求各位老师收留 +9 秋有木北 2026-03-14 9/450 2026-03-18 19:49 by macy2011
[考研] 一志愿中国海洋大学，生物学，301分，求调剂 +4 1孙悟空 2026-03-17 4/200 2026-03-18 17:59 by fivewind
[考研] 0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章 +7 rare12345 2026-03-18 7/350 2026-03-18 14:31 by laoshidan
[考研] 0703化学求调剂 总分331 +3 ZY-05 2026-03-13 3/150 2026-03-18 10:58 by macy2011
[考研] 268求调剂 +6 简单点0 2026-03-17 6/300 2026-03-18 09:04 by 无际的草原
[考研] 考研化学学硕调剂，一志愿985 +4 张vvvv 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:15 by ruiyingmiao
[考研] 274求调剂 +5 时间点 2026-03-13 5/250 2026-03-17 07:34 by 热情沙漠
[考研] 318求调剂 +3 Yanyali 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:41 by houyaoxu
[考研] 321求调剂 +5 大米饭！ 2026-03-15 5/250 2026-03-16 16:33 by houyaoxu
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 328求调剂 +3 5201314Lsy！ 2026-03-13 6/300 2026-03-14 15:31 by hyswxzs
[考研] 学硕285求调剂 +13 Wisjxn 2026-03-12 46/2300 2026-03-14 10:33 by JourneyLucky
[考研] 329求调剂 +3 miaodesi 2026-03-12 4/200 2026-03-13 20:53 by 18595523086
[考研] 274求调剂 +3 S.H1 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:15 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 程雨杭 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:06 by JourneyLucky
[考研] 土木第一志愿276求调剂，科研和技能十分丰富，求新兴方向的导师收留 +3 土木小天才 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:01 by JourneyLucky
[考研] 0817化学工程与技术考研312分调剂 +3 T123 tt 2026-03-12 3/150 2026-03-13 10:49 by houyaoxu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭