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zoe回望

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 请问真菌PCR时的通用引物ITS1和ITS4与ITS1和ITS2的应用差别 已有1人参与

最近在做真菌的PCR查资料发现真菌PCR时的通用引物常用的有两组:ITS1和ITS4以及ITS1和ITS2,想请问做过的大神哈,这两组除了序列不同外,在其他方面上有什么差别,我查文献看ITS1和ITS4扩增的是18s的最后一部分及28s开头的一部分和5.8S的全部,但是我没有找到ITS1和ITS2的扩增区域,实验室买的的ITS1和ITS4。还是说其实真菌PCR时的通用引物只有这么一组ITS1和ITS4,十分感谢。
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xuweitao

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
2楼2016-04-22 12:07:04
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草溪河

铁虫 (著名写手)

这两对引物用一对就行了吧,可以考虑其他保守基因引物啊

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3楼2016-04-22 13:02:09
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zoe回望

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xuweitao at 2016-04-22 12:07:04
http://sites.biology.duke.edu/fungi/mycolab/primers.htm

仔细看看引物反向和位置

好的,十分感谢大神,如果有问题还希望大神继续解答

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4楼2016-04-22 23:11:43
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zoe回望

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 草溪河 at 2016-04-22 13:02:09
这两对引物用一对就行了吧,可以考虑其他保守基因引物啊

嗯嗯,确实实验室也只买了一对,我就是想知道两对区别,而且最近发现PCR出不来条带了。请问大神,如何鉴定引物还能不能用啊?非常感谢

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5楼2016-04-22 23:13:13
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zoe回望

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xuweitao at 2016-04-22 12:07:04
http://sites.biology.duke.edu/fungi/mycolab/primers.htm

仔细看看引物反向和位置

请问大神,有没有法子鉴定引物是否正常啊?非常感谢

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6楼2016-04-22 23:14:07
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宾-仔

新虫 (小有名气)

1和2扩出来只有300bp,扩的是ITS1区

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7楼2016-04-26 00:14:35
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zoe回望

铁杆木虫 (正式写手)

8楼2016-04-26 08:12:29
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