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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 分子动力学模拟为什么要优化
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xie158795

金虫 (小有名气)

[求助] 分子动力学模拟为什么要优化 已有5人参与

本人初学者，分子动力学模拟为什么要结构优化？

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愿同志同道和的人前行！
1楼 2016-04-15 00:21:19
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
把理想转化为现实。振动一下。
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2楼2016-04-15 08:11:41
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一次性保温杯

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
优化就是求整个体系的最小能量结构呀，没准你画出来的水分子氢氧氢夹角是50°，优化就能把他变成正常的角度
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3楼2016-04-15 09:35:02
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sciencejoy

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
没有优化这一步也是可以的。只要你保证统计结果不依赖初始条件就可以。
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4楼2016-04-15 10:11:19
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殷赋科技

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xie158795: 金币+5, ★有帮助 2016-04-15 16:24:59
主要原因是：实验得出的一般是晶体结构，而不是溶液状态下的，我们做优化的原因是做动力学的初始结构的结果往往是不合理的，不优化的话体系的能力会很高。了解更多可以私聊我2843243792
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5楼2016-04-15 10:32:10
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zsilence

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
初始结构不一定合理  比如晶格常数后面只有短短的几位  另外初始结构没有温度 赋初始速度之后不一定平衡
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6楼2016-04-16 10:15:00
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