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cpzyyan

铜虫 (初入文坛)

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[交流] 求助：单晶编辑的问题(小弟是初学者)，各位高手帮帮忙阿

求助：单晶编辑的问题(小弟是初学者)，各位高手帮帮忙阿

小弟是一个刚刚接触晶体的初学者，其几天做了一个晶体，投了篇单晶，但是编辑给了几个问题我无法回答（我是学有机的，晶体的知识几乎一点不懂），望各位高手不吝赐教阿，帮帮忙阿。小弟的金币不多，愿全部拿出。请帮助阿。

问题如下：（cif见附件）
1. Please pay attention on checkCIF/PLATON results list (ALERTS LEVEL
C)
and:
a) complete in Your CIF SYMMETRY_SPACE_GROUP_NAME_HALL string;
b) correct SYMMETRY_SPACE_GROUP_NAME_H-M string to 'P n a 21';
c) correct the VOLUME value string;
d) correct the SUM_FORMULA string - see Notes for Authors;
e) correct the MOIETY_FORMULA string - see Notes for Authors;
f) correct the Z string - You have two independent molecules.
[search]单晶编辑[/search]

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1楼 2008-10-24 10:45:32

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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

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虫号: 354550
注册: 2007-04-24
专业: 结构化学

金币就不要了.
常上来吧.

关于几个alert c,再说几句,

Alert level C
PLAT220_ALERT_2_C Large Non-Solvent O    Ueq(max)/Ueq(min) ...    2.97 Ratio
PLAT220_ALERT_2_C Large Non-Solvent O    Ueq(max)/Ueq(min) ...    3.00 Ratio

这两个是由于O4, O8 的温度因子太大. 首先,要确人它们是氧,而不是N, C之类的.其次,虽然它们周围有残余峰,可以
处理成无序, 能降点温度因子,但会产生出新的alert c

PLAT066_ALERT_1_C Predicted and Reported Transmissions Identical .       ?

这是因为在ins中加了SIZE, 实际的吸收校正的Tmin, Tmax要从数据还原后的文件中找.

PLAT480_ALERT_4_C Long H...A H-Bond Reported H1A ..  O9    ..    2.65 Ang.
PLAT480_ALERT_4_C Long H...A H-Bond Reported H4A ..  O12    ..    2.68 Ang.

这两个氢键的角度太小,H...A距离太大,或许可以从CIF中把它们删去.