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求助：单晶编辑的问题(小弟是初学者)，各位高手帮帮忙阿
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求助：单晶编辑的问题(小弟是初学者)，各位高手帮帮忙阿 小弟是一个刚刚接触晶体的初学者，其几天做了一个晶体，投了篇单晶，但是编辑给了几个问题我无法回答（我是学有机的，晶体的知识几乎一点不懂），望各位高手不吝赐教阿，帮帮忙阿。小弟的金币不多，愿全部拿出。请帮助阿。 问题如下：（cif见附件） 1. Please pay attention on checkCIF/PLATON results list (ALERTS LEVEL C) and: a) complete in Your CIF SYMMETRY_SPACE_GROUP_NAME_HALL string; b) correct SYMMETRY_SPACE_GROUP_NAME_H-M string to 'P n a 21'; c) correct the VOLUME value string; d) correct the SUM_FORMULA string - see Notes for Authors; e) correct the MOIETY_FORMULA string - see Notes for Authors; f) correct the Z string - You have two independent molecules. [search]单晶编辑[/search] |
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2楼2008-10-24 14:24:12
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seasedoctor(金币+4,VIP+0):你经常活跃在晶体版，帮助了很多人。谢谢！
cpzyyan(金币+4,VIP+0):谢谢 xi2004大哥的热心帮助。
seasedoctor(金币+4,VIP+0):你经常活跃在晶体版，帮助了很多人。谢谢！
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投到哪里去了? 我帮你改了一下, CIF在 http://www.namipan.com/d/cif.sav ... 2f1f43c0e986b560000 你的文件我也帮你传到纳米盘了(链, 谁好心再帮他解决一下剩下的alert c http://www.namipan.com/d/R81016E ... 15a244f216c101a0400 剩下几个aleart C, 哪个N1-H1a 用个 dfix 0.87 0.01 n1 h1a 就可以了. 其他的不好解决. O4, O8肯定是O吗? Alert level C PLAT220_ALERT_2_C Large Non-Solvent O Ueq(max)/Ueq(min) ... 2.97 Ratio PLAT220_ALERT_2_C Large Non-Solvent O Ueq(max)/Ueq(min) ... 3.00 Ratio PLAT353_ALERT_3_C Long N-H Bond (0.87A) N1 - H1A ... 1.07 Ang. PLAT066_ALERT_1_C Predicted and Reported Transmissions Identical . ? PLAT480_ALERT_4_C Long H...A H-Bond Reported H1A .. O9 .. 2.65 Ang. PLAT480_ALERT_4_C Long H...A H-Bond Reported H4A .. O12 .. 2.68 Ang. |
6楼2008-10-24 17:17:03
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金币就不要了. 常上来吧.  关于几个alert c,再说几句, Alert level C PLAT220_ALERT_2_C Large Non-Solvent O Ueq(max)/Ueq(min) ... 2.97 Ratio PLAT220_ALERT_2_C Large Non-Solvent O Ueq(max)/Ueq(min) ... 3.00 Ratio 这两个是由于O4, O8 的温度因子太大. 首先,要确人它们是氧,而不是N, C之类的.其次,虽然它们周围有残余峰,可以 处理成无序, 能降点温度因子,但会产生出新的alert c PLAT066_ALERT_1_C Predicted and Reported Transmissions Identical . ? 这是因为在ins中加了SIZE, 实际的吸收校正的Tmin, Tmax要从数据还原后的文件中找. PLAT480_ALERT_4_C Long H...A H-Bond Reported H1A .. O9 .. 2.65 Ang. PLAT480_ALERT_4_C Long H...A H-Bond Reported H4A .. O12 .. 2.68 Ang. 这两个氢键的角度太小,H...A距离太大,或许可以从CIF中把它们删去. |
9楼2008-10-24 20:00:29
10楼2008-10-25 13:46:44
