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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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ly_0

新虫 (初入文坛)

[求助] Cytoscape求助 已有2人参与

用Cytoscape做GO分析，得到的网络似乎有点大。想要取P值高的，想根据P值大小排个序，可是下边的P值被认定是字符串，要咋办啊？

Cytoscape求助
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1楼 2016-04-12 22:12:13
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ly_0

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by kuyi2 at 2016-05-20 11:10:57
有没有中文教程，发一份

http://www.plob.org/2013/10/26/6289.html
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  • 附件 1 : Cytoscape使用方法(正式版本).pdf
    • 2016-06-03 18:21:21, 2.12 M
6楼2016-06-03 18:22:35
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ly_0

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 泥娃娃5330 at 2016-05-31 23:07:16
楼主怎么做的图  怎么得到的数据，刚刚接触，很多都不懂！

我用的STRING数据库：http://string-db.org/
数据库把网络建好后把网络文件（TSV格式的）下载下来，在Cytoscape中
导入（File → Import → Network(Multiple File Types）
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8楼2016-06-03 18:45:20
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普通回帖

kuyi2

木虫 (正式写手)
请教下怎么倒入数据啊？
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2楼2016-05-20 11:08:34
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kuyi2

木虫 (正式写手)
有没有中文教程，发一份
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3楼2016-05-20 11:10:57
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泥娃娃5330

新虫 (初入文坛)
楼主怎么做的图  怎么得到的数据，刚刚接触，很多都不懂！

发自小木虫Android客户端
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4楼2016-05-31 23:07:16
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珍维永久

金虫 (小有名气)
楼主，蛋白通路的网络怎么构建呢？能否告诉下一般步骤呢，不胜感激！
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5楼2016-06-02 17:05:53
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ly_0

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 珍维永久 at 2016-06-02 17:05:53
楼主，蛋白通路的网络怎么构建呢？能否告诉下一般步骤呢，不胜感激！

我参考的这个：http://www.plob.org/2013/10/26/6289.html
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7楼2016-06-03 18:32:04
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夕枫L

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by ly_0 at 2016-06-03 18:45:20
我用的STRING数据库：http://string-db.org/
数据库把网络建好后把网络文件（TSV格式的）下载下来，在Cytoscape中
导入（File → Import → Network(Multiple File Types）...

楼主，小弟不才最近也在弄cytoscape，想咨询您关于cytoscape插件clusterONE的使用
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9楼2016-08-25 11:14:40
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夕枫L

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

LZ，为什么用cytoscape来做GO分析呢？最近才开始学，没想到cytoscape还能做GO分析。clusterONE插件用的会吗？可以分析出modules吗？
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10楼2016-08-25 11:24:51
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