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Cytoscape求助
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用Cytoscape做GO分析,得到的网络似乎有点大。想要取P值高的,想根据P值大小排个序,可是下边的P值被认定是字符串,要咋办啊?
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1楼
2016-04-12 22:12:13
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3楼
:
Originally posted by
kuyi2
at 2016-05-20 11:10:57
有没有中文教程,发一份
http://www.plob.org/2013/10/26/6289.html
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Cytoscape使用方法(正式版本).pdf
2016-06-03 18:21:21, 2.12 M
6楼
2016-06-03 18:22:35
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4楼
:
Originally posted by
泥娃娃5330
at 2016-05-31 23:07:16
楼主怎么做的图 怎么得到的数据,刚刚接触,很多都不懂!
我用的STRING数据库:
http://string-db.org/
数据库把网络建好后把网络文件(TSV格式的)下载下来,在Cytoscape中
导入(File → Import → Network(Multiple File Types)
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8楼
2016-06-03 18:45:20
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kuyi2
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请教下怎么倒入数据啊?
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2楼
2016-05-20 11:08:34
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kuyi2
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3楼
2016-05-20 11:10:57
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泥娃娃5330
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楼主怎么做的图 怎么得到的数据,刚刚接触,很多都不懂!
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4楼
2016-05-31 23:07:16
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珍维永久
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楼主,蛋白通路的网络怎么构建呢?能否告诉下一般步骤呢,不胜感激!
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5楼
2016-06-02 17:05:53
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5楼
:
Originally posted by
珍维永久
at 2016-06-02 17:05:53
楼主,蛋白通路的网络怎么构建呢?能否告诉下一般步骤呢,不胜感激!
我参考的这个:
http://www.plob.org/2013/10/26/6289.html
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7楼
2016-06-03 18:32:04
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夕枫L
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8楼
:
Originally posted by
ly_0
at 2016-06-03 18:45:20
我用的STRING数据库:http://string-db.org/
数据库把网络建好后把网络文件(TSV格式的)下载下来,在Cytoscape中
导入(File → Import → Network(Multiple File Types)...
楼主,小弟不才最近也在弄cytoscape,想咨询您关于cytoscape插件clusterONE的使用
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9楼
2016-08-25 11:14:40
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夕枫L
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LZ,为什么用cytoscape来做GO分析呢?最近才开始学,没想到cytoscape还能做GO分析。clusterONE插件用的会吗?可以分析出modules吗?
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10楼
2016-08-25 11:24:51
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