应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » Cytoscape求助
111/2返回列表12下一页
查看: 5090  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

ly_0

新虫 (初入文坛)

[求助] Cytoscape求助 已有2人参与

用Cytoscape做GO分析，得到的网络似乎有点大。想要取P值高的，想根据P值大小排个序，可是下边的P值被认定是字符串，要咋办啊？

Cytoscape求助
Image 2.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-04-12 22:12:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

ly_0

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by kuyi2 at 2016-05-20 11:10:57
有没有中文教程，发一份

http://www.plob.org/2013/10/26/6289.html
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : Cytoscape使用方法(正式版本).pdf
    • 2016-06-03 18:21:21, 2.12 M
6楼2016-06-03 18:22:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ly_0

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 泥娃娃5330 at 2016-05-31 23:07:16
楼主怎么做的图  怎么得到的数据，刚刚接触，很多都不懂！

我用的STRING数据库：http://string-db.org/
数据库把网络建好后把网络文件（TSV格式的）下载下来，在Cytoscape中
导入（File → Import → Network(Multiple File Types）
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2016-06-03 18:45:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

kuyi2

木虫 (正式写手)
请教下怎么倒入数据啊？
赞一下 回复此楼
2楼2016-05-20 11:08:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kuyi2

木虫 (正式写手)
有没有中文教程，发一份
赞一下 回复此楼
3楼2016-05-20 11:10:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

泥娃娃5330

新虫 (初入文坛)
楼主怎么做的图  怎么得到的数据，刚刚接触，很多都不懂！

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
4楼2016-05-31 23:07:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

珍维永久

金虫 (小有名气)
楼主，蛋白通路的网络怎么构建呢？能否告诉下一般步骤呢，不胜感激！
赞一下 回复此楼
5楼2016-06-02 17:05:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ly_0

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 珍维永久 at 2016-06-02 17:05:53
楼主，蛋白通路的网络怎么构建呢？能否告诉下一般步骤呢，不胜感激！

我参考的这个：http://www.plob.org/2013/10/26/6289.html
赞一下 回复此楼
7楼2016-06-03 18:32:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

夕枫L

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by ly_0 at 2016-06-03 18:45:20
我用的STRING数据库：http://string-db.org/
数据库把网络建好后把网络文件（TSV格式的）下载下来，在Cytoscape中
导入（File → Import → Network(Multiple File Types）...

楼主，小弟不才最近也在弄cytoscape，想咨询您关于cytoscape插件clusterONE的使用
赞一下 回复此楼
9楼2016-08-25 11:14:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

夕枫L

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

LZ，为什么用cytoscape来做GO分析呢？最近才开始学，没想到cytoscape还能做GO分析。clusterONE插件用的会吗？可以分析出modules吗？
赞一下 回复此楼
10楼2016-08-25 11:24:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ly_0 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 9/450 2026-08-21 15:38 by dcqxinyang
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +11 大萍1987 2026-08-20 13/650 2026-08-21 14:48 by 20120902066
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +15 医学老男孩 2026-08-20 18/900 2026-08-21 13:46 by 医学老男孩
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +23 yaoyewhu2008 2026-08-20 25/1250 2026-08-21 12:19 by Poppy1104
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +15 archvillain 2026-08-15 27/1350 2026-08-21 11:32 by tim76
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 13/650 2026-08-21 08:30 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +4 archvillain 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:10 by gatelove
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低？主要原因有哪些？ +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜吗？ +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[精细化工] 招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭