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younggood

铜虫 (小有名气)

[求助] 降低能垒 已有1人参与

我用高斯b3lyp方法找到了一个过渡态，用irc找到反应物后，用了b3lyp方法加溶剂甲醇做单点，结果，反应物到过渡态的能垒相差很大，有47kcal/mol,因为二者的gibbs差别不是很大，而加上溶剂化效应后的单点能才很大，我认为的是我的溶剂化效应的方法有问题，我又尝试了其它方法b3lypD3,M06方法算溶剂化效应，结果能垒只是降低了1-2kcal/mol，请问各位大神，我作溶剂化效应单点时用什么方法能让能垒降低呢，因为一直没有办法降低这个高的能垒，想听听你们的建议，非常感谢
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1楼 2016-04-08 11:17:58
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1989shaonan

金虫 (小有名气)
1. 溶剂效应本身会影响反应的电子活化能。你采用的计算方法大概是：气相优化+溶剂单点能。溶剂单点能得到的活化能与气相得到的活化能有差异是正常的，改变基组、泛函对不会有大的改变；
2. 如果体系不大，可以在溶剂化中进行过渡态优化、irc计算和反应物优化，然后再进行溶剂单点计算。
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2楼2016-04-09 10:03:31
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younggood

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 1989shaonan at 2016-04-09 10:03:31
1. 溶剂效应本身会影响反应的电子活化能。你采用的计算方法大概是：气相优化+溶剂单点能。溶剂单点能得到的活化能与气相得到的活化能有差异是正常的，改变基组、泛函对不会有大的改变；
2. 如果体系不大，可以在溶 ...

哦，是这样的，我是溶剂中优化找过渡态+溶剂单点能，而溶剂优化找过渡态的反应物和过渡态gibbs差别很小，而加上溶剂化效应后的单点能才很大，请问是怎么回事呢
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3楼2016-04-10 21:13:15
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1989shaonan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
younggood: 金币+10, ★有帮助 2016-04-11 10:44:09
引用回帖:
3楼: Originally posted by younggood at 2016-04-10 21:13:15
哦，是这样的，我是溶剂中优化找过渡态+溶剂单点能，而溶剂优化找过渡态的反应物和过渡态gibbs差别很小，而加上溶剂化效应后的单点能才很大，请问是怎么回事呢...

1. 这就是主体溶剂效应的影响。对于你在溶剂化中优化的反应物和过渡态，直接作单点得到活化能Δ E, 在溶剂化中作单点得到活化能Δ E(aq)，两者有差异是正常的。以前的做法通常是“气相优化+溶剂化单点”，现在计算能力提高了，就采用”溶剂优化+溶剂化单点“，一般在计算单点能时还是要考虑溶剂化效应；
2. 如果你采用溶剂化单点能得到的活化能与实验值相差很大，一个可能的原因是真实溶剂效应（即溶质周围的甲醇分子）有实质性影响。可以尝试在溶质周围排布几个甲醇分子，然后”直接优化+溶剂化单点“，或”溶剂优化+溶剂化单点“。
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4楼2016-04-11 01:16:06
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younggood

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 1989shaonan at 2016-04-11 01:16:06
1. 这就是主体溶剂效应的影响。对于你在溶剂化中优化的反应物和过渡态，直接作单点得到活化能Δ E, 在溶剂化中作单点得到活化能Δ E(aq)，两者有差异是正常的。以前的做法通常是“气相优化+溶剂化单点”，现在计算 ...

哦哦，我先试试把甲醇和它们放在一起优化吧，谢谢了
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5楼2016-04-11 10:45:07
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liuchangchi

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by younggood at 2016-04-11 10:45:07
哦哦，我先试试把甲醇和它们放在一起优化吧，谢谢了...

你好，我现在在做薄膜这一块，看到溶剂化作用可以有效减少薄膜的污染，但对这一块不是特别了解， 想咨询一下你，或者有什么建议吗？
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6楼2016-04-12 16:45:48
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