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younggood铜虫 (小有名气)
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降低能垒 已有1人参与
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| 我用高斯b3lyp方法找到了一个过渡态,用irc找到反应物后,用了b3lyp方法加溶剂甲醇做单点,结果,反应物到过渡态的能垒相差很大,有47kcal/mol,因为二者的gibbs差别不是很大,而加上溶剂化效应后的单点能才很大,我认为的是我的溶剂化效应的方法有问题,我又尝试了其它方法b3lypD3,M06方法算溶剂化效应,结果能垒只是降低了1-2kcal/mol,请问各位大神,我作溶剂化效应单点时用什么方法能让能垒降低呢,因为一直没有办法降低这个高的能垒,想听听你们的建议,非常感谢 |
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2楼2016-04-09 10:03:31
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3楼2016-04-10 21:13:15
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【答案】应助回帖
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younggood: 金币+10, ★有帮助 2016-04-11 10:44:09
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1. 这就是主体溶剂效应的影响。对于你在溶剂化中优化的反应物和过渡态,直接作单点得到活化能Δ E, 在溶剂化中作单点得到活化能Δ E(aq),两者有差异是正常的。以前的做法通常是“气相优化+溶剂化单点”,现在计算能力提高了,就采用”溶剂优化+溶剂化单点“,一般在计算单点能时还是要考虑溶剂化效应; 2. 如果你采用溶剂化单点能得到的活化能与实验值相差很大,一个可能的原因是真实溶剂效应(即溶质周围的甲醇分子)有实质性影响。可以尝试在溶质周围排布几个甲醇分子,然后”直接优化+溶剂化单点“,或”溶剂优化+溶剂化单点“。 |
4楼2016-04-11 01:16:06
younggood
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5楼2016-04-11 10:45:07
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