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sunny0819

新虫 (小有名气)

[求助] MLST分析大神已有1人参与

已测序完,想要和MLST官网上序列进行比对确定ST分型,可是要怎么比对,百度了好多,都没有详细的步骤,进入MLST官网发现数据分析那块网页打不开呢,是在那里分析吗?还是我找错了,金币不多,做过的麻烦解答下吧!!!跪谢!!!

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sunny0819

新虫 (小有名气)

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4楼2016-05-11 12:51:21
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sunny0819

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by binge920612 at 2016-04-21 17:34:12
我也是刚刚学会,叙述不对的地方请谅解。
下面已单增李斯特菌为例:
1、将测序完的碱基序列复制到次网站窗口中http://bigsdb.web.pasteur.fr/perl/bigsdb/bigsdb.pl?db=pubmlst_listeria_seqdef_public&page= ...

谢谢~

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5楼2016-05-11 12:51:37
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sunny0819

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by solomon7811 at 2016-05-12 06:29:06
不同的菌可能在不同的网站。有些网站以前接收MLST,现在可能不接收了,比如大肠杆菌有两个网站,其中一个改为接受NGS了。

嗯嗯,我找肺克的,MLST上也找不到

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7楼2016-05-12 18:33:00
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