24小时热门版块排行榜    

查看: 1006  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

pf2012

新虫 (初入文坛)

[求助] 怎么分析全基因序列分析后的的蛋白质氨基酸残留位点?

本人最近在分析了流感病毒的全基因序列后,看到其他文献除了分析进化树外,还分析了HA、NA、NS、PA等蛋白质重要氨基酸残留位点,想请教各位前辈该怎么分析,谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pf2012

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by Cathering_w at 2016-04-02 18:10:12
看些生物信息学的蛋白质结构的方面的文献

好的,谢谢你!
8楼2016-04-02 19:28:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

jackyoung

新虫 (正式写手)

这得是个多么拗口的东西……如果是你表述不准确,还请贴个上下文,至少是全称,就那几个字母和你那么拗口的表述真的是没sei能帮你了………

发自小木虫Android客户端
CestLaVie
2楼2016-04-01 18:42:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pf2012

新虫 (初入文坛)

好的,谢谢提醒。
本人最近对流感病毒的一种亚型进行了基因测序,可以进行全基因组分析,参考一部分文献后,发现一般进行全基因序列分析主要是从进化树和蛋白质(HA、NA、NS、PA等)氨基酸残留位点进行分析,所以,想请教前辈这个氨基酸残留位点该怎么分析?如下表,是怎么分析的,谢谢
Virus        HA*                                                  NA
        Receptor binding  site        Cleavage site          Stalk deletions
        109 161        163 191        198 202        203 333-341            258        392          63-65
        Y    W         T   N         T   L        Y   RSSRGLF             K         V          Yes
3楼2016-04-01 20:21:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Cathering_w

新虫 (正式写手)

通常会找些已经表征了的同源性高的基因的文献,参照他们的氨基酸分析结果对自己的进行分析

发自小木虫Android客户端
博士终于毕业了,未来还有什么困难能难得倒我呢!加油我得未来。
4楼2016-04-01 22:31:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见