应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 怎么分析全基因序列分析后的的蛋白质氨基酸残留位点？
51/1返回列表
查看: 1192  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

pf2012

新虫 (初入文坛)

[求助] 怎么分析全基因序列分析后的的蛋白质氨基酸残留位点？

本人最近在分析了流感病毒的全基因序列后，看到其他文献除了分析进化树外，还分析了HA、NA、NS、PA等蛋白质重要氨基酸残留位点，想请教各位前辈该怎么分析，谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-04-01 18:05:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Cathering_w

新虫 (正式写手)
通常会找些已经表征了的同源性高的基因的文献，参照他们的氨基酸分析结果对自己的进行分析

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
博士终于毕业了，未来还有什么困难能难得倒我呢！加油我得未来。
4楼2016-04-01 22:31:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

jackyoung

新虫 (正式写手)
这得是个多么拗口的东西……如果是你表述不准确，还请贴个上下文，至少是全称，就那几个字母和你那么拗口的表述真的是没sei能帮你了………

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
CestLaVie
2楼2016-04-01 18:42:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pf2012

新虫 (初入文坛)
好的，谢谢提醒。
本人最近对流感病毒的一种亚型进行了基因测序，可以进行全基因组分析，参考一部分文献后，发现一般进行全基因序列分析主要是从进化树和蛋白质（HA、NA、NS、PA等）氨基酸残留位点进行分析，所以，想请教前辈这个氨基酸残留位点该怎么分析？如下表，是怎么分析的，谢谢
Virus        HA*                                                  NA
        Receptor binding  site        Cleavage site          Stalk deletions
        109 161        163 191        198 202        203 333-341            258        392          63-65
        Y    W         T   N         T   L        Y   RSSRGLF             K         V          Yes
赞一下 回复此楼
3楼2016-04-01 20:21:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pf2012

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by Cathering_w at 2016-04-01 22:31:50
通常会找些已经表征了的同源性高的基因的文献，参照他们的氨基酸分析结果对自己的进行分析

谢谢。你的意思是这些位点都是先从文献中找吗？然后怎么分析呢？是分析文献中的基因和自己的结果是不是有不同？
赞一下 回复此楼
5楼2016-04-02 14:15:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭