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pf2012

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[求助] 怎么分析全基因序列分析后的的蛋白质氨基酸残留位点？

本人最近在分析了流感病毒的全基因序列后，看到其他文献除了分析进化树外，还分析了HA、NA、NS、PA等蛋白质重要氨基酸残留位点，想请教各位前辈该怎么分析，谢谢！

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1楼 2016-04-01 18:05:47

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jackyoung

新虫 (正式写手)

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这得是个多么拗口的东西……如果是你表述不准确，还请贴个上下文，至少是全称，就那几个字母和你那么拗口的表述真的是没sei能帮你了………

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CestLaVie

2楼2016-04-01 18:42:50

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pf2012

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好的，谢谢提醒。
本人最近对流感病毒的一种亚型进行了基因测序，可以进行全基因组分析，参考一部分文献后，发现一般进行全基因序列分析主要是从进化树和蛋白质（HA、NA、NS、PA等）氨基酸残留位点进行分析，所以，想请教前辈这个氨基酸残留位点该怎么分析？如下表，是怎么分析的，谢谢
Virus HA*                                           NA
Receptor binding  site Cleavage site    Stalk deletions
109 161 163 191 198 202 203 333-341       258 392    63-65
      Y W    T N    T L Y RSSRGLF       K    V    Yes

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3楼2016-04-01 20:21:49

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