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钻石分子动态建模 已有2人参与
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研究生毕业论文教授要求用mathematica进行分子动力学建模。 看了两本书有了大概的思路。 疑惑的是 建模第一步计算立场 计算一个分子的力场书上有基本的计算力场的方法也有一些由经验来的比如mm amber 等简化的立场。 但是钻石是晶体结构 没有分子式。我应该怎样处理这个问题，怎样来计算钻石的力场。还有公式里所有的参数在哪里能查到？ 希望前辈们能给提供帮助，初来乍到给没有金币可以贡献。本人学的是机械系统工程教授给了我一个对于我来说全新的题目。希望能和大家多交流。 发自小木虫IOS客户端 |
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明白你的意思了，弄懂了边界条件的建立，比如我要模拟3.3.3个晶胞就应该建立一个5.5.5的模型。我最近看了很多讲tersoff的资料大多都是讲了计算的原理和参数。对于怎样建立坐标系模拟的具体步骤并不清楚。因为我是要用mathmatica来建模程序都要自己编写。所以想知道坐标系怎么建立的。比如我要模拟一个5.5.5的金刚石模型大概有1000多个原子，每个原子的坐标我都要自己计算出来吗？ 发自小木虫IOS客户端 |
10楼2016-04-10 17:47:19
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能否再多给点信息？ 钻石就是金刚石，一种结构的C，标准的金刚石结构是固定的，也很好建，如果单纯建模也不需要力场，所以： 1、你的要求就只是建出模型就可以了？还是要有后续计算？ 2、你所说的模型要求多大？比如多少个原子或尺寸？ |
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4楼2016-04-01 08:36:46
