24小时热门版块排行榜    

查看: 1486  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

Masterarbeit

新虫 (初入文坛)

[交流] 钻石分子动态建模 已有2人参与

研究生毕业论文教授要求用mathematica进行分子动力学建模。 看了两本书有了大概的思路。 疑惑的是 建模第一步计算立场 计算一个分子的力场书上有基本的计算力场的方法也有一些由经验来的比如mm amber 等简化的立场。 但是钻石是晶体结构 没有分子式。我应该怎样处理这个问题,怎样来计算钻石的力场。还有公式里所有的参数在哪里能查到?  希望前辈们能给提供帮助,初来乍到给没有金币可以贡献。本人学的是机械系统工程教授给了我一个对于我来说全新的题目。希望能和大家多交流。

发自小木虫IOS客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Masterarbeit

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by abinitio at 2016-04-08 08:00:27
每个单位是这样的。我所说的8*8*8是指在xyz三个方向上重复8次,当然你也可以多或者少...

明白你的意思了,弄懂了边界条件的建立,比如我要模拟3.3.3个晶胞就应该建立一个5.5.5的模型。我最近看了很多讲tersoff的资料大多都是讲了计算的原理和参数。对于怎样建立坐标系模拟的具体步骤并不清楚。因为我是要用mathmatica来建模程序都要自己编写。所以想知道坐标系怎么建立的。比如我要模拟一个5.5.5的金刚石模型大概有1000多个原子,每个原子的坐标我都要自己计算出来吗?

发自小木虫IOS客户端
10楼2016-04-10 17:47:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

Masterarbeit

新虫 (初入文坛)

2楼2016-03-31 02:56:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Masterarbeit

新虫 (初入文坛)

3楼2016-03-31 14:49:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
能否再多给点信息?
钻石就是金刚石,一种结构的C,标准的金刚石结构是固定的,也很好建,如果单纯建模也不需要力场,所以:
1、你的要求就只是建出模型就可以了?还是要有后续计算?
2、你所说的模型要求多大?比如多少个原子或尺寸?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2016-04-01 08:36:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +4 Tide man 2026-08-11 4/200 2026-08-12 00:39 by liuqidi
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +17 Lanmanbaby 2026-08-09 29/1450 2026-08-12 00:24 by zhanghaozhu
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 9/450 2026-08-11 22:12 by 医学老男孩
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +8 Tide man 2026-08-10 9/450 2026-08-11 20:39 by beefly
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +3 布布和一二 2026-08-11 4/200 2026-08-11 15:20 by aasahr
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +3 工厂打螺丝 2026-08-08 3/150 2026-08-11 13:42 by 会议编辑
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] filecode +9 documentary 2026-08-10 9/450 2026-08-11 10:08 by wk7465
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
信息提示
请填处理意见