| 查看: 1975 | 回复: 2 | ||
[求助]
mRNA-Seq文库构建实验原理相关问题求助 已有1人参与
|
|
初接触mRNA-Seq文库构建实验，用的VATHS mRNA v2 Library Prep Kit。有些原理相关的小白问题请教，望各位别取笑多指教 1. 用磁珠将mRNA从总RNA中纯化出来的原理是什么呢？为什么专用磁珠只吸附mRNA？ 2. 打断mRNA使之片段化的原理是什么？用什么试剂？为什么可以打断？ 3. 为什么要末端修复？是怎么修复的？用的什么试剂？原理是什么？过程怎么样的？ 4. 为什么要末端dA-tailing？用的什么试剂？原理是什么？过程怎么样的？ 5. 接头是什么结构的？怎么设计接头？接头退火的过程是怎么样的？ 6. 文库扩增时用的引物怎么设计的？是什么样的序列？扩增过程？ |
回复此楼» 猜你喜欢
苯并呋咱全解析：NBD 荧光衍生化试剂母核的化学特性与实验室应用
已经有0人回复
-
生物质炭与活化剂氢氧化钾混合注意事项
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有293人回复
-
科研人必读：新一代 KRAS G12C 抑制剂 Olomorasib 的研究进展
已经有0人回复
-
BT-11（Omilancor）研究化合物全解析：从分子结构到实验应用要点
已经有0人回复
-
富马酸贝达喹啉：二芳基喹啉类工具化合物的化学特征
已经有0人回复
-
BT投稿with editor状态快两周了，正常吗
已经有25人回复
-
Silevertinib（BDTX-1535）结构拆解：炔基双环片段为何成为合成瓶颈
已经有0人回复
-
RO4929097 解析：双苯并氮杂䓬骨架与 Notch 通路实验设计要点
已经有0人回复
-
分子量 1157 的 PROTAC 怎么配不析出：SGK3-PROTAC1 的溶解、分装与图谱复核
已经有0人回复
-
logP 6.1 的羧酸怎么配母液：GSK 650394 的溶解窗口与稀释顺序
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
jianguochen
新虫 (小有名气)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 1196.5
- 红花: 4
- 帖子: 60
- 在线: 39.7小时
- 虫号: 2525581
- 注册: 2013-06-29
- 专业: 植物病理学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
doushifish: 金币+50, ★★★很有帮助 2016-04-01 08:42:08
感谢参与，应助指数 +1
doushifish: 金币+50, ★★★很有帮助 2016-04-01 08:42:08
|
1.利用成熟mRNA的poly A tail 特性，磁珠上有修饰oligo dT，与mRNA退火就捕获了mRNA。 2.楼主的试剂盒应该是利用盐离子在加热下打断mRNA的。 3.打断的mRNA反转录之后末端可能有多种情况，但后续的步骤需要先将末端补平，一般就是用DNA polymerase。 4.dA tailing 就是在补平的末端加A，而接头有一个突出的T，这样就TA连接了，末端加A的酶有好几种，你的是哪个我也不知道。 5.不同建库试剂盒的接头类型不一样，比如Y型，颈环等，接头设计比较多样化，一时也说不清楚，你可以看看illumina的接头信息。 6.同5 |
doushifish2楼2016-03-30 14:58:15
3楼2016-03-31 09:28:03
