24小时热门版块排行榜    

查看: 271  |  回复: 1
当前主题已经存档。

Dadiqiu

铜虫 (小有名气)

[交流] 求助,cif中加入氢键后出现很多A,C类错误

如题,在没加入氢键时,没有A错误了,可按照platon算的结果,把氢键加到cif中后,出现很多A错误,请各位前辈帮忙。

PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc   15.126(4), Rep    3.170(9), Dev..    2989.00 Sigma
              N3   -N2      1.555   2.575                                      
PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc    9.545(3), Rep    3.005(3), Dev..    2180.00 Sigma
              N3   -O1      1.555   8.565                                      
PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc   12.043(4), Rep    3.263(9), Dev..    2195.00 Sigma
              C3   -O1      1.555   5.555                                      
PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc   14.613(4), Rep    2.923(4), Dev..    2922.50 Sigma
              C4   -N2      1.555   2.565                                      
PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc   10.938(3), Rep    3.327(7), Dev..    2537.00 Sigma
              C4   -O1      1.555   5.555                                      
PLAT726_ALERT_1_A H...A   Calc    14.65000, Rep     2.40000 Dev...      12.25 Ang.
              H5   -N2      1.555   2.575                                      
PLAT726_ALERT_1_A H...A   Calc    10.28000, Rep     2.15000 Dev...       8.13 Ang.
              H6   -O1      1.555   8.565                                      
PLAT726_ALERT_1_A H...A   Calc    11.34000, Rep     2.51000 Dev...       8.83 Ang.
              H2   -O1      1.555   5.555                                      
PLAT726_ALERT_1_A H...A   Calc    14.76000, Rep     2.49000 Dev...      12.27 Ang.
              H3   -N2      1.555   2.565                                      
PLAT726_ALERT_1_A H...A   Calc    10.13000, Rep     2.53000 Dev...       7.60 Ang.
              H4   -O1      1.555   5.555                                      
PLAT728_ALERT_1_A D-H..A  Calc      123.00, Rep      150.00 Dev...      27.00 Deg.
              N3   -H5   -N2      1.555   1.555   2.575                        
PLAT728_ALERT_1_A D-H..A  Calc       29.00, Rep      172.00 Dev...     143.00 Deg.
              N3   -H6   -O1      1.555   1.555   8.565                        
PLAT728_ALERT_1_A D-H..A  Calc       79.00, Rep      107.00 Dev...      28.00 Deg.
              C4   -H3   -N2      1.555   1.555   2.565                        
PLAT728_ALERT_1_A D-H..A  Calc      145.00, Rep      140.00 Dev...       5.00 Deg.
              C4   -H4   -O1      1.555   1.555   5.555                        
。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。
我加的氢键为:

loop_
_geom_hbond_atom_site_label_D
_geom_hbond_atom_site_label_H
_geom_hbond_atom_site_label_A
_geom_hbond_distance_DH
_geom_hbond_distance_HA
_geom_hbond_distance_DA
_geom_hbond_angle_DHA
_geom_hbond_site_symmetry_A
_geom_hbond_publ_flag
# Hydrogen bonding scheme
# D    H     A   D-H      H...A    D...A     D-H...A   SYMM   PUBL
N3   H5       N1    0.860    2.460    2.814(2)  105.00    .      yes
N3   H5       N2    0.860    2.400    3.170(9)  150.00    2_575  yes
N3   H6       O1    0.860    2.150    3.005(3)  172.00    8_565  yes   
C3   H2       O1    0.930    2.510    3.263(9)  139.00    5_555  yes  
C4   H3       N2    0.970    2.490    2.923(4)  107.00    2_565  yes
C4   H4       O1    0.970    2.530    3.327(7)  140.00    5_555  yes
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
Dadiqiu(金币+10,VIP+0):强烈支持,感谢!
应该是对称操作码错了.
参见我以前的贴子.
xi2004-emuch@163.com
2楼2008-10-20 22:10:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Dadiqiu 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +8 布布和一二 2026-08-08 14/700 2026-08-09 11:05 by liangsi2003
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 5/250 2026-08-08 21:54 by 13586093586
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +3 布布和一二 2026-08-08 3/150 2026-08-08 18:15 by Lightingo
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:22 by oEVWOejN9taj
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:19 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 5/250 2026-08-08 17:02 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 6/300 2026-08-08 15:07 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 WQyTGMbfH7Cx 2026-08-07 4/200 2026-08-08 15:02 by oEVWOejN9taj
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:39 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:07 by oEVWOejN9taj
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:07 by oEVWOejN9taj
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 3/150 2026-08-08 03:47 by 6vVgjDL4CnGu
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
信息提示
请填处理意见