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Dadiqiu

铜虫 (小有名气)

[交流] 求助,cif中加入氢键后出现很多A,C类错误

如题,在没加入氢键时,没有A错误了,可按照platon算的结果,把氢键加到cif中后,出现很多A错误,请各位前辈帮忙。

PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc   15.126(4), Rep    3.170(9), Dev..    2989.00 Sigma
              N3   -N2      1.555   2.575                                      
PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc    9.545(3), Rep    3.005(3), Dev..    2180.00 Sigma
              N3   -O1      1.555   8.565                                      
PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc   12.043(4), Rep    3.263(9), Dev..    2195.00 Sigma
              C3   -O1      1.555   5.555                                      
PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc   14.613(4), Rep    2.923(4), Dev..    2922.50 Sigma
              C4   -N2      1.555   2.565                                      
PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc   10.938(3), Rep    3.327(7), Dev..    2537.00 Sigma
              C4   -O1      1.555   5.555                                      
PLAT726_ALERT_1_A H...A   Calc    14.65000, Rep     2.40000 Dev...      12.25 Ang.
              H5   -N2      1.555   2.575                                      
PLAT726_ALERT_1_A H...A   Calc    10.28000, Rep     2.15000 Dev...       8.13 Ang.
              H6   -O1      1.555   8.565                                      
PLAT726_ALERT_1_A H...A   Calc    11.34000, Rep     2.51000 Dev...       8.83 Ang.
              H2   -O1      1.555   5.555                                      
PLAT726_ALERT_1_A H...A   Calc    14.76000, Rep     2.49000 Dev...      12.27 Ang.
              H3   -N2      1.555   2.565                                      
PLAT726_ALERT_1_A H...A   Calc    10.13000, Rep     2.53000 Dev...       7.60 Ang.
              H4   -O1      1.555   5.555                                      
PLAT728_ALERT_1_A D-H..A  Calc      123.00, Rep      150.00 Dev...      27.00 Deg.
              N3   -H5   -N2      1.555   1.555   2.575                        
PLAT728_ALERT_1_A D-H..A  Calc       29.00, Rep      172.00 Dev...     143.00 Deg.
              N3   -H6   -O1      1.555   1.555   8.565                        
PLAT728_ALERT_1_A D-H..A  Calc       79.00, Rep      107.00 Dev...      28.00 Deg.
              C4   -H3   -N2      1.555   1.555   2.565                        
PLAT728_ALERT_1_A D-H..A  Calc      145.00, Rep      140.00 Dev...       5.00 Deg.
              C4   -H4   -O1      1.555   1.555   5.555                        
。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。
我加的氢键为:

loop_
_geom_hbond_atom_site_label_D
_geom_hbond_atom_site_label_H
_geom_hbond_atom_site_label_A
_geom_hbond_distance_DH
_geom_hbond_distance_HA
_geom_hbond_distance_DA
_geom_hbond_angle_DHA
_geom_hbond_site_symmetry_A
_geom_hbond_publ_flag
# Hydrogen bonding scheme
# D    H     A   D-H      H...A    D...A     D-H...A   SYMM   PUBL
N3   H5       N1    0.860    2.460    2.814(2)  105.00    .      yes
N3   H5       N2    0.860    2.400    3.170(9)  150.00    2_575  yes
N3   H6       O1    0.860    2.150    3.005(3)  172.00    8_565  yes   
C3   H2       O1    0.930    2.510    3.263(9)  139.00    5_555  yes  
C4   H3       N2    0.970    2.490    2.923(4)  107.00    2_565  yes
C4   H4       O1    0.970    2.530    3.327(7)  140.00    5_555  yes
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
Dadiqiu(金币+10,VIP+0):强烈支持,感谢!
应该是对称操作码错了.
参见我以前的贴子.
xi2004-emuch@163.com
2楼2008-10-20 22:10:10
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