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Dadiqiu铜虫 (小有名气)
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[交流]
求助,cif中加入氢键后出现很多A,C类错误
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如题,在没加入氢键时,没有A错误了,可按照platon算的结果,把氢键加到cif中后,出现很多A错误,请各位前辈帮忙。 : PLAT707_ALERT_1_A D...A Calc 15.126(4), Rep 3.170(9), Dev.. 2989.00 Sigma N3 -N2 1.555 2.575 PLAT707_ALERT_1_A D...A Calc 9.545(3), Rep 3.005(3), Dev.. 2180.00 Sigma N3 -O1 1.555 8.565 PLAT707_ALERT_1_A D...A Calc 12.043(4), Rep 3.263(9), Dev.. 2195.00 Sigma C3 -O1 1.555 5.555 PLAT707_ALERT_1_A D...A Calc 14.613(4), Rep 2.923(4), Dev.. 2922.50 Sigma C4 -N2 1.555 2.565 PLAT707_ALERT_1_A D...A Calc 10.938(3), Rep 3.327(7), Dev.. 2537.00 Sigma C4 -O1 1.555 5.555 PLAT726_ALERT_1_A H...A Calc 14.65000, Rep 2.40000 Dev... 12.25 Ang. H5 -N2 1.555 2.575 PLAT726_ALERT_1_A H...A Calc 10.28000, Rep 2.15000 Dev... 8.13 Ang. H6 -O1 1.555 8.565 PLAT726_ALERT_1_A H...A Calc 11.34000, Rep 2.51000 Dev... 8.83 Ang. H2 -O1 1.555 5.555 PLAT726_ALERT_1_A H...A Calc 14.76000, Rep 2.49000 Dev... 12.27 Ang. H3 -N2 1.555 2.565 PLAT726_ALERT_1_A H...A Calc 10.13000, Rep 2.53000 Dev... 7.60 Ang. H4 -O1 1.555 5.555 PLAT728_ALERT_1_A D-H..A Calc 123.00, Rep 150.00 Dev... 27.00 Deg. N3 -H5 -N2 1.555 1.555 2.575 PLAT728_ALERT_1_A D-H..A Calc 29.00, Rep 172.00 Dev... 143.00 Deg. N3 -H6 -O1 1.555 1.555 8.565 PLAT728_ALERT_1_A D-H..A Calc 79.00, Rep 107.00 Dev... 28.00 Deg. C4 -H3 -N2 1.555 1.555 2.565 PLAT728_ALERT_1_A D-H..A Calc 145.00, Rep 140.00 Dev... 5.00 Deg. C4 -H4 -O1 1.555 1.555 5.555 。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。 我加的氢键为: loop_ _geom_hbond_atom_site_label_D _geom_hbond_atom_site_label_H _geom_hbond_atom_site_label_A _geom_hbond_distance_DH _geom_hbond_distance_HA _geom_hbond_distance_DA _geom_hbond_angle_DHA _geom_hbond_site_symmetry_A _geom_hbond_publ_flag # Hydrogen bonding scheme # D H A D-H H...A D...A D-H...A SYMM PUBL N3 H5 N1 0.860 2.460 2.814(2) 105.00 . yes N3 H5 N2 0.860 2.400 3.170(9) 150.00 2_575 yes N3 H6 O1 0.860 2.150 3.005(3) 172.00 8_565 yes C3 H2 O1 0.930 2.510 3.263(9) 139.00 5_555 yes C4 H3 N2 0.970 2.490 2.923(4) 107.00 2_565 yes C4 H4 O1 0.970 2.530 3.327(7) 140.00 5_555 yes |
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